MirGeneDB ID | Dlo-Iab-4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | IAB-4 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Braconid wasp (Diachasmimorpha longicaudata) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Dlo-Iab-4-as | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Iab-4-P1 Aae-Iab-4-P1-as Aae-Iab-4-P2 Aae-Iab-4-P2-as Aga-Iab-4 Aga-Iab-4-as Bge-Iab-4 Bge-Iab-4-as Csc-Iab-4-P6 Csc-Iab-4-P6-as Csc-Iab-4-P7 Csc-Iab-4-P7-as Dan-Iab-4 Dan-Iab-4-as Dma-Iab-4 Dme-Iab-4 Dme-Iab-4-as Dmo-Iab-4 Dmo-Iab-4-as Dpu-Iab-4 Dpu-Iab-4-as Dsi-Iab-4 Dsi-Iab-4-as Dya-Iab-4 Dya-Iab-4-as Gpa-Iab-4 Hme-Iab-4 Hme-Iab-4-as Isc-Iab-4 Lpo-Iab-4-P3 Lpo-Iab-4-P3-as Lpo-Iab-4-P4 Lpo-Iab-4-P5 Lpo-Iab-4-P5-as Tca-Iab-4 Tca-Iab-4-as | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Arthropoda | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Arthropoda | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCF_034640455.1_iyDiaLong2_genomic) |
NC_087226.1: 4752788-4752845 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Iab-4) |
Iab-4
NC_087226.1: 4752788-4752845 [-]
Ensembl
Iab-4-as NC_087226.1: 4752788-4752849 [+] Ensembl |
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Seed | CGUAUAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUCUCUGAUGAGUGAUGUGAAGCCCCCUGUACGUAUACUGAAUGUAUCCUGAGUGUAAUCCUGUCCGGUAUACCUUCAGUAUACGUAACAGGAGGCUACACCGAUCGACGAUGAUCUUGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 UUCUCUGAUGAGUGAUG- A C - U -| U GUGUA UG AGCC CCUG UACGUAUACUGAA GUAU CC GA \ AC UCGG GGAC AUGCAUAUGACUU CAUA GG CU A UUCUAGUAGCAGCUAGCC A A A C U^ C GUCCU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Dlo-Iab-4_5p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- ACGUAUACUGAAUGUAUCCUGA -22
Get sequence
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Star sequence | Dlo-Iab-4_3p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- CGGUAUACCUUCAGUAUACGUAA -58
Get sequence
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