MirGeneDB ID | Csc-Iab-4-P7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | IAB-4 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Arizona bark scorpion (Centruroides sculpturatus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Csc-Iab-4-P6 Csc-Iab-4-P6-as Csc-Iab-4-P7-as | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aga-Iab-4 Bge-Iab-4 Dan-Iab-4 Dlo-Iab-4 Dma-Iab-4 Dme-Iab-4 Dmo-Iab-4 Dpu-Iab-4 Dsi-Iab-4 Dya-Iab-4 Gpa-Iab-4 Hme-Iab-4 Isc-Iab-4 Tca-Iab-4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | C. sculpturatus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Arthropoda | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCF_000671375.1_CSC) |
NW_019384783.1: 169684-169743 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Iab-4-P7) |
Iab-4-P7-as
NW_019384783.1: 169682-169742 [-]
Ensembl
Iab-4-P7 NW_019384783.1: 169684-169743 [+] Ensembl |
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Seed | CGUAUAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AAAGAUGGUUAACAUAGCAAUGCCUCCUGUUCGUAUACUGAAUGUAUCCUGAGUUAAUUUUACUUUCCGGUAUACCUUCAGUAUACGUAGCAGGAGACACUGAGCUCUCAUCGAUCCUCCGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 AAAGAUGGUUAACAUAG- A C - U -| U GUUAAU CA UG CUCCUGUU CGUAUACUGAA GUAU CC GA \ GU AC GAGGACGA GCAUAUGACUU CAUA GG CU U CCUCCUAGCUACUCUCGA C A U C U^ C UUCAUU . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Csc-Iab-4-P7_5p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UCGUAUACUGAAUGUAUCCUGA -22
Get sequence
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Star sequence | Csc-Iab-4-P7_3p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- GGUAUACCUUCAGUAUACGUAG -60
Get sequence
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