MirGeneDB ID | Dlo-Iab-4-as | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | IAB-4 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Braconid wasp (Diachasmimorpha longicaudata) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Dlo-Iab-4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aga-Iab-4 Aga-Iab-4-as Bge-Iab-4 Bge-Iab-4-as Dan-Iab-4 Dan-Iab-4-as Dma-Iab-4 Dme-Iab-4 Dme-Iab-4-as Dmo-Iab-4 Dmo-Iab-4-as Dpu-Iab-4 Dpu-Iab-4-as Dsi-Iab-4 Dsi-Iab-4-as Dya-Iab-4 Dya-Iab-4-as Gpa-Iab-4 Hme-Iab-4 Hme-Iab-4-as Isc-Iab-4 Tca-Iab-4 Tca-Iab-4-as | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Pancrustacea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Arthropoda | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCF_034640455.1_iyDiaLong2_genomic) |
NC_087226.1: 4752788-4752849 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Iab-4-as) |
Iab-4
NC_087226.1: 4752788-4752845 [-]
Ensembl
Iab-4-as NC_087226.1: 4752788-4752849 [+] Ensembl |
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Seed | UACGUAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AAGAUCAUCGUCGAUCGGUGUAGCCUCCUGUUACGUAUACUGAAGGUAUACCGGACAGGAUUACACUCAGGAUACAUUCAGUAUACGUACAGGGGGCUUCACAUCACUCAUCAGAGAAGAACGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 AAGAUCAUCGUCGAUCG---| U U G A CGGACAGGA GUG AGCCUCCUGU ACGUAUACUGAA GUAU C \ CAC UCGGGGGACA UGCAUAUGACUU CAUA G U CAAGAAGAGACUACUCACUA^ U - A - GACUCACAU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Dlo-Iab-4-as_5p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UUACGUAUACUGAAGGUAUAC -21
Get sequence
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Star sequence | Dlo-Iab-4-as_3p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
41- AUACAUUCAGUAUACGUACAG -62
Get sequence
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