Browse

47 microRNA genes with node of origin T. urticae
						Sort by genome coordinates								Motifs
MirGeneDB ID ▲	MiRBase ID	Family	Seed	5p accession	3p accession	Chromosome	Start	End	Strand	Node of origin (locus)	Node of origin (family)	IsomiR	3' NTU	UG	UGUG	CNNC
Tur-Mir-2-o142a	tur-mir-2-1	MIR-2	AUCACAG	MIMAT0023042	MIMAT0023043	HE587310.1	2525606	2525669	+	T. urticae	Protostomia		No
Tur-Mir-2-o142b	tur-mir-2-2	MIR-2	AUCACAG	MIMAT0023042	MIMAT0023043	HE587310.1	2523054	2523117	-	T. urticae	Protostomia		No
Tur-Mir-2-o143	None	MIR-2	AUCACAG	None	None	HE587302.1	3261040	3261110	+	T. urticae	Protostomia		No	1
Tur-Mir-7-P28	tur-mir-7	MIR-7	GGAAGAC	MIMAT0023036	MIMAT0023037	HE587302.1	1216514	1216576	-	T. urticae	Bilateria		No		1
Tur-Mir-7-P29	None	MIR-7	GGAAGAC	None	None	HE587312.1	2160396	2160460	-	T. urticae	Bilateria		Unknown		1	1
Tur-Mir-10-P1y	None	MIR-10	CUCUGUA	None	None	HE587311.1	780226	780287	-	T. urticae	Eumetazoa		No			1
Tur-Mir-10-P1z ^V	tur-mir-10	MIR-10	CCCUGUA	MIMAT0023026	MIMAT0023027	HE587320.1	1111621	1111681	+	T. urticae	Eumetazoa	2	No
Tur-Mir-10-P4u	tur-mir-993b	MIR-10	ACCCUGU	MIMAT0023052	MIMAT0023053	HE587311.1	2466151	2466214	-	T. urticae	Eumetazoa		No
Tur-Mir-10-P4v	tur-mir-993a-2	MIR-10	ACCCUGU	MIMAT0023058	MIMAT0023059	HE587311.1	2465365	2465427	-	T. urticae	Eumetazoa		No			1
Tur-Mir-10-P4w	tur-mir-993a-1	MIR-10	ACCCUGU	MIMAT0023058	MIMAT0023059	HE587311.1	2464812	2464873	-	T. urticae	Eumetazoa		No
Tur-Mir-12-P14	tur-mir-12a	MIR-12	GAGUAUU	MIMAT0023102	MIMAT0023103	HE587328.1	1008240	1008300	+	T. urticae	Protostomia		No			1
Tur-Mir-12-P15	tur-mir-12b	MIR-12	GAGUAUU	MIMAT0023044	MIMAT0023045	HE587311.1	1901159	1901218	-	T. urticae	Protostomia		No
Tur-Mir-36-P30	None	MIR-36	GGUGGCU	None	None	HE587309.1	1096172	1096231	+	T. urticae	Protostomia		No			1
Tur-Mir-36-P31	None	MIR-36	GGUGGCU	None	None	HE587309.1	1096273	1096332	+	T. urticae	Protostomia		No			1
Tur-Mir-36-P32	None	MIR-36	GGUGGCU	None	None	HE587309.1	1096476	1096535	+	T. urticae	Protostomia		No			1
Tur-Mir-36-P33	None	MIR-36	GGUGGCU	None	None	HE587309.1	1096578	1096637	+	T. urticae	Protostomia		No			1
Tur-Mir-36-P34	None	MIR-36	GGUGGCU	None	None	HE587309.1	1096882	1096941	+	T. urticae	Protostomia		No			1
Tur-Mir-36-P35	None	MIR-36	GGUGGCU	None	None	HE587309.1	1096984	1097043	+	T. urticae	Protostomia		No			1
Tur-Mir-36-P36	None	MIR-36	CACCGGG	None	None	HE587309.1	1097086	1097144	+	T. urticae	Protostomia		No			1
Tur-Mir-71-P6a	tur-mir-71-1	MIR-71	CUCACUA	MIMAT0023040	MIMAT0023041	HE587310.1	2524818	2524890	+	T. urticae	Nephrozoa		No			1
Tur-Mir-71-P6b	tur-mir-71-2	MIR-71	CUCACUA	MIMAT0023040	MIMAT0023041	HE587310.1	2523836	2523908	-	T. urticae	Nephrozoa		No			1
Tur-Mir-87-o38	None	MIR-87	UGAGCAA	None	None	HE587301.1	4415425	4415497	-	T. urticae	Protostomia		No			1
Tur-Mir-87-o39	tur-mir-87	MIR-87	AGCCGGA	MIMAT0023066	MIMAT0023067	HE587301.1	4415225	4415289	-	T. urticae	Protostomia		No			1
Tur-Mir-87-o40	None	MIR-87	UGAGCAA	None	None	HE587301.1	4415090	4415158	-	T. urticae	Protostomia		No			1
Tur-Mir-87-o41	None	MIR-87	UGAGCAA	None	None	HE587301.1	4414906	4414965	-	T. urticae	Protostomia		No
Tur-Mir-92-P21	None	MIR-92	AUUGCAC	None	None	HE587307.1	1360151	1360224	+	T. urticae	Bilateria		No
Tur-Mir-92-P22	None	MIR-92	AUUGCAC	None	None	HE587304.1	3805132	3805205	-	T. urticae	Bilateria		No
Tur-Mir-92-P23	tur-mir-92	MIR-92	AUUGCAC	MIMAT0023086	MIMAT0023087	HE587317.1	1593042	1593106	+	T. urticae	Bilateria		No
Tur-Mir-124-P46	tur-mir-124-1	MIR-124	AAGGCAC	MIMAT0023088	MIMAT0023089	HE587309.1	2159035	2159097	+	T. urticae	Bilateria		No
Tur-Mir-124-P47	tur-mir-124-2	MIR-124	AAGGCAC	MIMAT0026457	MIMAT0023089	HE587309.1	2159846	2159908	+	T. urticae	Bilateria		No			1
Tur-Mir-210-P21	None	MIR-210	UGUGCGU	None	None	HE587323.1	68257	68325	+	T. urticae	Bilateria		No	1		1
Tur-Mir-210-P22	None	MIR-210	UGUGCGU	None	None	HE587323.1	74280	74348	-	T. urticae	Bilateria		No	1		1
Tur-Mir-279-P26	None	MIR-279	GACUAGA	None	None	HE587309.1	1091933	1091994	+	T. urticae	Protostomia		No	1	1	1
Tur-Mir-279-P27a	tur-mir-279	MIR-279	GACUAGA	MIMAT0023106	MIMAT0023107	HE587308.1	2468600	2468662	-	T. urticae	Protostomia		No
Tur-Mir-279-P27b	tur-mir-279	MIR-279	GACUAGA	MIMAT0023106	MIMAT0023107	HE587308.1	2463767	2463829	-	T. urticae	Protostomia		No
Tur-Mir-5731-P1a	tur-mir-5731	MIR-5731	UGGGCAC	MIMAT0023056	MIMAT0023057	HE587494.1	1952	2039	-	T. urticae	T. urticae		No	1		1
Tur-Mir-5731-P1b	tur-mir-5731	MIR-5731	UGGGCAC	MIMAT0023056	MIMAT0023057	HE587494.1	6201	6288	-	T. urticae	T. urticae		No	1		1
Tur-Mir-5731-P1c	tur-mir-5731	MIR-5731	UGGGCAC	MIMAT0023056	MIMAT0023057	HE587301.1	1420763	1420850	-	T. urticae	T. urticae		No	1		1
Tur-Mir-5733	tur-mir-5733	MIR-5733	ACUUGAU	MIMAT0023064	MIMAT0023065	HE587301.1	1416967	1417036	-	T. urticae	T. urticae		No			1
Tur-Mir-5734	tur-mir-5734	MIR-5734	UGGGGUA	MIMAT0023074	MIMAT0023075	HE587301.1	1423018	1423077	-	T. urticae	T. urticae		No
Tur-Mir-5736 ^V	tur-mir-5736a	MIR-5736	UUCGCCA	MIMAT0023100	MIMAT0023101	HE587301.1	1424674	1424736	-	T. urticae	T. urticae	2	No
Tur-Mir-5738	tur-mir-5738	MIR-5738	AUGUAAU	MIMAT0023110	MIMAT0023111	HE587302.1	4314298	4314360	-	T. urticae	T. urticae		No
Tur-Novel-1	None	TUR-NOVEL-1	CGGAUUG	None	None	HE587302.1	6079671	6079731	+	T. urticae	T. urticae		No
Tur-Novel-2	None	TUR-NOVEL-2	UCACAAC	None	None	HE587314.1	2074896	2074957	+	T. urticae	T. urticae		No
Tur-Novel-3	None	TUR-NOVEL-3	AUAAAAU	None	None	HE587303.1	2777364	2777427	+	T. urticae	T. urticae		No
Tur-Novel-4	None	TUR-NOVEL-4	AGGAAAG	None	None	HE587327.1	533052	533118	+	T. urticae	T. urticae		No
Tur-Novel-5	None	TUR-NOVEL-5	ACCGGGA	None	None	HE587309.1	1096052	1096111	+	T. urticae	T. urticae		No		1	1

(red - mature/co-mature, blue - star)