MirGeneDB ID | Sto-Mir-191 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-191 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Cloudy Catshark (Scyliorhinus torazame) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aca-Mir-191 Ami-Mir-191 Bta-Mir-191 Cfa-Mir-191 Cja-Mir-191 Cmi-Mir-191 Cpi-Mir-191 Cpo-Mir-191 Dno-Mir-191 Dre-Mir-191 Eca-Mir-191 Ete-Mir-191 Gga-Mir-191-v1 Gja-Mir-191 Gmo-Mir-191 Hsa-Mir-191 Laf-Mir-191 Loc-Mir-191 Mal-Mir-191 Mdo-Mir-191 Mml-Mir-191 Mmr-Mir-191 Mmu-Mir-191 Mun-Mir-191 Neu-Mir-191 Oan-Mir-191 Ocu-Mir-191 Pab-Mir-191 Pbv-Mir-191 Rno-Mir-191 Sha-Mir-191 Spt-Mir-191 Tgu-Mir-191 Tni-Mir-191 Xla-Mir-191-P1 Xla-Mir-191-P2 Xtr-Mir-191 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_003427355_STO_add) |
BFAA01003406.1: 116588-116647 [+] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-191) |
Mir-191
BFAA01003406.1: 116588-116647 [+]
Mir-425 BFAA01003406.1: 122844-122905 [+] |
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Seed | AACGGAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGUUACCCUGACACUGUGUAUGAGUAGCACAAACGGAACCCCAAAAGUAGCUGUGAGCCUAGAAAUCGGCUGCUGUUGGGUUCUGUUACUGCUAGUCGUGGACUCACUGCUGGAAUGUCUGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 UGUUACCCUGACACUGUG--| G CA CAAA UGAGCC UAUGA UAGCA AACGGAACCC AGUAGCUG \ GUGCU AUCGU UUGUCUUGGG UCGUCGGC U UCUGUAAGGUCGUCACUCAG^ G CA UUG- UAAAGA . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Sto-Mir-191_5p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AAACGGAACCCCAAAAGUAGCUG -23
Get sequence
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Star sequence | Sto-Mir-191_3p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- GCUGCUGUUGGGUUCUGUUACU -60
Get sequence
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