MirGeneDB ID | Mun-Mir-191 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-191 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Microcaecilia (Microcaecilia unicolor) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aca-Mir-191 Ami-Mir-191 Bta-Mir-191 Cfa-Mir-191 Cja-Mir-191 Cmi-Mir-191 Cpi-Mir-191 Cpo-Mir-191 Dno-Mir-191 Dre-Mir-191 Eca-Mir-191 Ete-Mir-191 Gga-Mir-191-v1 Gja-Mir-191 Gmo-Mir-191 Hsa-Mir-191 Laf-Mir-191 Loc-Mir-191 Mal-Mir-191 Mdo-Mir-191 Mml-Mir-191 Mmr-Mir-191 Mmu-Mir-191 Neu-Mir-191 Oan-Mir-191 Ocu-Mir-191 Pab-Mir-191 Pbv-Mir-191 Rno-Mir-191 Sha-Mir-191 Spt-Mir-191 Sto-Mir-191 Tgu-Mir-191 Tni-Mir-191 Xla-Mir-191-P1 Xla-Mir-191-P2 Xtr-Mir-191 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_901765095.2_aMicUni1.2) |
LR594637.1: 139803592-139803652 [-] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-191) |
Mir-2970
LR594637.1: 139795933-139795991 [-]
Mir-425 LR594637.1: 139797021-139797083 [-] Mir-191 LR594637.1: 139803592-139803652 [-] |
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Seed | AACGGAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CACCACGACACAGAACAGCAUGAGAGCAGACAACGGAAUCCCAAAAGCAGCUGUUUUCAGAACAUCACAGCUGCCUUUGGAUUCUGUUACCUGUUCUCCUGCACAGACACCCGCUCUCUCCGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 CACCACGACACAGAACA--| U AC C A UUUUCA GCA GAGAGCAG AACGGAAUCC AAA GCAGCUG G CGU CUCUUGUC UUGUCUUAGG UUU CGUCGAC A CCUCUCUCGCCCACAGACA^ C CA - C ACUACA . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Mun-Mir-191_5p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CAACGGAAUCCCAAAAGCAGCUG -23
Get sequence
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Star sequence | Mun-Mir-191_3p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
39- GCUGCCUUUGGAUUCUGUUACC -61
Get sequence
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