| MirGeneDB ID | Pbv-Mir-191 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-191 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Burmese python (Python bivittatus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | pbv-mir-191 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aca-Mir-191 Ami-Mir-191 Bta-Mir-191 Cfa-Mir-191 Cja-Mir-191 Cmi-Mir-191 Cpi-Mir-191 Cpo-Mir-191 Dno-Mir-191 Dre-Mir-191 Eca-Mir-191 Ete-Mir-191 Gga-Mir-191-v1 Gja-Mir-191 Gmo-Mir-191 Hsa-Mir-191 Laf-Mir-191 Loc-Mir-191 Mal-Mir-191 Mdo-Mir-191 Mml-Mir-191 Mmr-Mir-191 Mmu-Mir-191 Mun-Mir-191 Neu-Mir-191 Oan-Mir-191 Ocu-Mir-191 Pab-Mir-191 Rno-Mir-191 Sha-Mir-191 Spt-Mir-191 Sto-Mir-191 Tgu-Mir-191 Tni-Mir-191 Xla-Mir-191-P1 Xla-Mir-191-P2 Xtr-Mir-191 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000186305.2_Python_molurus_bivittatus) |
KE954653.1: 219604-219667 [+] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-191) |
Mir-191
KE954653.1: 219604-219667 [+]
Mir-425 KE954653.1: 223828-223889 [+] Mir-2970 KE954653.1: 225941-225999 [+] |
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| Seed | AACGGAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UACCAGCUUCUAUGAAGGCAUAAGAAUGGGCAACGGAAUCCCAAAAGCAGCUGUUUUCCUCUGAGUCUUCCAGCUGCACUUGGAUUCCGUUCCUUGCUCUUUUGCUCACCUCUCCAGGAUUUCAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 UACCAGCUUCUAUGAAG-- U AU-| C C AA UUUUCCUC GCA AAGA GGG AACGGAAUCC AA GCAGCUG \ CGU UUCU UCC UUGCCUUAGG UU CGUCGAC U ACUUUAGGACCUCUCCACU U CGU^ - - CA CUUCUGAG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Pbv-Mir-191_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0038987 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CAACGGAAUCCCAAAAGCAGCUG -23
Get sequence
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| Star sequence | Pbv-Mir-191_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0038988 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
42- GCUGCACUUGGAUUCCGUUCCU -64
Get sequence
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