MirGeneDB ID | Mml-Mir-92-P2c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-92 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mml-mir-363 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Mml-Mir-92-P1a Mml-Mir-92-P1c Mml-Mir-92-P1d Mml-Mir-92-P2a Mml-Mir-92-P2d | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aca-Mir-92-P2c Ami-Mir-92-P2c Asu-Mir-92 Bfl-Mir-92-o2 Bla-Mir-92-o2 Bta-Mir-92-P2c Cel-Mir-92 Cfa-Mir-92-P2c Cja-Mir-92-P2c Cli-Mir-92-P2c Cmi-Mir-92-P2c Cpi-Mir-92-P2c Cpo-Mir-92-P2c Dno-Mir-92-P2c Dre-Mir-92-P2c Eca-Mir-92-P2c Esc-Mir-92 Ete-Mir-92-P2c Gga-Mir-92-P2c Gja-Mir-92-P2c Gmo-Mir-92-P2c Gsp-Mir-92 Hmi-Mir-92 Hsa-Mir-92-P2c Isc-Mir-92 Laf-Mir-92-P2c Lch-Mir-92-P2c Loc-Mir-92-P2c Mdo-Mir-92-P2c Mmr-Mir-92-P2c Mmu-Mir-92-P2c Mun-Mir-92-P2c Neu-Mir-92-P2c Oan-Mir-92-P2c Obi-Mir-92 Ocu-Mir-92-P2c Pab-Mir-92-P2c Pbv-Mir-92-P2c Rno-Mir-92-P2c Sha-Mir-92-P2c Sme-Mir-92 Spt-Mir-92-P2c Sto-Mir-92-P2c Tgu-Mir-92-P2c Xla-Mir-92-P2c3 Xla-Mir-92-P2c4 Xtr-Mir-92-P2c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_003339765.3_Mmul_10_traces) |
CM014356.1: 130425071-130425135 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-92-P2c) |
Mir-92-P2c
CM014356.1: 130425071-130425135 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-92-P1c CM014356.1: 130425233-130425293 [-] UCSC Ensembl Mir-19-P2c CM014356.1: 130425372-130425437 [-] UCSC Ensembl Mir-17-P4c CM014356.1: 130425501-130425561 [-] UCSC Ensembl Mir-17-P2c CM014356.1: 130425731-130425795 [-] UCSC Ensembl Mir-17-P1c CM014356.1: 130425897-130425955 [-] UCSC Ensembl |
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Seed | AUUGCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UCACUGUAAUAUGAUCUGUUUUGCUGUUGUCGGGUGGAUCACGAUGCAAUUUUGAUUAGUAUCAUAGGAGAAAAAUUGCACGGUAUCCAUCUGUAAACCGCAGGACCUUUGUUGGCAACAUUCCCGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 UCACUGUAAUAUGAUCU--| U GU CA A GAUUAGUA GUUUUGC GUU CGGGUGGAU CG UGCAAUUUU U CAGGACG CAA GUCUACCUA GC ACGUUAAAA C CCCUUACAACGGUUGUUUC^ C AU UG - AGAGGAUA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mml-Mir-92-P2c_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0026855 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CGGGUGGAUCACGAUGCAAUUUU -23
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-363-5p |
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Mature sequence | Mml-Mir-92-P2c_3p |
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mirBase accession | MIMAT0006290 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
43- AAUUGCACGGUAUCCAUCUGUA -65
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-363-3p |