| MirGeneDB ID | Lan-Mir-315 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-315 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UUUGAUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Lingula (Lingula anatina) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-315 Bge-Mir-315 Bpl-Mir-315 Cbr-Mir-315 Cel-Mir-315 Cgi-Mir-315-v1 Cgi-Mir-315-v2 Csc-Mir-315 Cte-Mir-315 Dan-Mir-315 Dma-Mir-315 Dme-Mir-315 Dmo-Mir-315 Dpu-Mir-315 Dsi-Mir-315 Dya-Mir-315 Efe-Mir-315 Esc-Mir-315 Isc-Mir-315 Lgi-Mir-315 Lpo-Mir-315-P3 Lpo-Mir-315-P4 Lpo-Mir-315-P5 Lpo-Mir-315-P6-v1 Lpo-Mir-315-P6-v2 Npo-Mir-315 Obi-Mir-315 Ovu-Mir-315 Pfl-Mir-315 Pma-Mir-315 Sko-Mir-315 Sme-Mir-315 Tca-Mir-315 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (LinAna_1.0) |
LFEI01000117: 452001-452059 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UGGGUGCCUAGAAACCACCAUCUCCUCAUAUUUUGAUUGUUGCUCAGAAUGUCGUGAUAUUUAAUGGCAUUUGGGCACCAAUCAGAGCCUGAAGGAGACACCAGAUCGUCAUGAAGCACGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UGGGUGCCUAGAAACCACCA- -| UA U A GUGAU UCUCC UCA UUUUGAUUG UGCUCAGA UGUC A AGAGG AGU GAGACUAAC ACGGGUUU ACGG U CACGAAGUACUGCUAGACCAC A^ CC C - UAAUU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Lan-Mir-315_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUUUGAUUGUUGCUCAGAAUGUC -23
Get sequence
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| Star sequence | Lan-Mir-315_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- CAUUUGGGCACCAAUCAGAGCC -59
Get sequence
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