MirGeneDB 2.1
MirGeneDB ID

Cpo-Mir-430-P5

Family name MIR-430 (all species)
Seed AGUGCCG
Species Guinea pig (Cavia porcellus)
MiRBase ID cpo-mir-290
Paralogues Cpo-Mir-430-o28  Cpo-Mir-430-P1  Cpo-Mir-430-P2  Cpo-Mir-430-P3  Cpo-Mir-430-P4 
Orthologues Bta-Mir-430-P5  Cfa-Mir-430-P5d1  Cfa-Mir-430-P5d2  Dno-Mir-430-P5  Ete-Mir-430-P5  Hsa-Mir-430-P5  Mml-Mir-430-P5  Mmu-Mir-430-P5a  Mmu-Mir-430-P5b  Mmu-Mir-430-P5c  Ocu-Mir-430-P5  Rno-Mir-430-P5a  Rno-Mir-430-P5b  Rno-Mir-430-P5c  Xla-Mir-430-o5o1  Xla-Mir-430-o5o2  Xla-Mir-430-o5p1  Xla-Mir-430-o5p2  Xla-Mir-430-o5q1  Xla-Mir-430-o5q2  Xla-Mir-430-o5r  Xla-Mir-430-o5s  Xtr-Mir-430-o5a1  Xtr-Mir-430-o5a2  Xtr-Mir-430-o5a3  Xtr-Mir-430-o5a4  Xtr-Mir-430-o5a5  Xtr-Mir-430-o5a6  Xtr-Mir-430-o5a7  Xtr-Mir-430-o5a8  Xtr-Mir-430-o5a9  Xtr-Mir-430-o5a10  Xtr-Mir-430-o5a11  Xtr-Mir-430-o5a12  Xtr-Mir-430-o5a13  Xtr-Mir-430-o5a14  Xtr-Mir-430-o5a15  Xtr-Mir-430-o5a16  Xtr-Mir-430-o5a17  Xtr-Mir-430-o5a18  Xtr-Mir-430-o5a19  Xtr-Mir-430-o5a20  Xtr-Mir-430-o5a21  Xtr-Mir-430-o5a22  Xtr-Mir-430-o5a23  Xtr-Mir-430-o5b  Xtr-Mir-430-o5c1  Xtr-Mir-430-o5c2  Xtr-Mir-430-o5c3  Xtr-Mir-430-o5c4  Xtr-Mir-430-o5c5  Xtr-Mir-430-o5c6  Xtr-Mir-430-o5c7  Xtr-Mir-430-o5c8  Xtr-Mir-430-o5c9  Xtr-Mir-430-o5c10  Xtr-Mir-430-o5c11  Xtr-Mir-430-o5c12  Xtr-Mir-430-o5c13  Xtr-Mir-430-o5c14  Xtr-Mir-430-o5c15  Xtr-Mir-430-o5c16  Xtr-Mir-430-o5c17  Xtr-Mir-430-o5c18  Xtr-Mir-430-o5c19  Xtr-Mir-430-o5c20  Xtr-Mir-430-o5c21  Xtr-Mir-430-o5c22  Xtr-Mir-430-o5c23  Xtr-Mir-430-o5c24  Xtr-Mir-430-o5c25  Xtr-Mir-430-o5d1  Xtr-Mir-430-o5d2  Xtr-Mir-430-o5e  Xtr-Mir-430-o5f1  Xtr-Mir-430-o5f2  Xtr-Mir-430-o5g  Xtr-Mir-430-o5h  Xtr-Mir-430-o5j  Xtr-Mir-430-o5k1  Xtr-Mir-430-o5k2  Xtr-Mir-430-o5k3  Xtr-Mir-430-o5k4  Xtr-Mir-430-o5k5  Xtr-Mir-430-o5k6  Xtr-Mir-430-o5k7  Xtr-Mir-430-o5k8  Xtr-Mir-430-o5k9  Xtr-Mir-430-o5k10  Xtr-Mir-430-o5k11  Xtr-Mir-430-o5k12  Xtr-Mir-430-o5k13  Xtr-Mir-430-o5k14  Xtr-Mir-430-o5k15  Xtr-Mir-430-o5k16  Xtr-Mir-430-o5k17  Xtr-Mir-430-o5k18  Xtr-Mir-430-o5k19  Xtr-Mir-430-o5k20  Xtr-Mir-430-o5k21  Xtr-Mir-430-o5k22  Xtr-Mir-430-o5k23  Xtr-Mir-430-o5k24  Xtr-Mir-430-o5k25  Xtr-Mir-430-o5k26  Xtr-Mir-430-o5k27  Xtr-Mir-430-o5l1  Xtr-Mir-430-o5l2  Xtr-Mir-430-o5l3  Xtr-Mir-430-o5l4  Xtr-Mir-430-o5l5  Xtr-Mir-430-o5l6  Xtr-Mir-430-o5l7  Xtr-Mir-430-o5l8  Xtr-Mir-430-o5l9  Xtr-Mir-430-o5l10  Xtr-Mir-430-o5l11  Xtr-Mir-430-o5l12  Xtr-Mir-430-o5l13  Xtr-Mir-430-o5l14  Xtr-Mir-430-o5l15  Xtr-Mir-430-o5l16  Xtr-Mir-430-o5l17  Xtr-Mir-430-o5l18  Xtr-Mir-430-o5l19  Xtr-Mir-430-o5m  Xtr-Mir-430-o5n1  Xtr-Mir-430-o5n2 
Node of Origin (locus) Eutheria
Node of Origin (family) Vertebrata
Genome context
(cavPor3)		 scaffold_70: 3074407-3074465 [-] UCSC
Clustered miRNAs
(< 50kb from Mir-430-P5)		 Mir-430-P5 scaffold_70: 3074407-3074465 [-] UCSC
Mir-430-o28 scaffold_70: 3095374-3095431 [-] UCSC
Precursor
(pre-Mir +30nt flank)
GCUCUGGCCCAGGUCUCCUCUGUCUGCGCCACUCAAACUUCGGGGGCACUUUGUAAUGUGGACCUAAAGUGCCGCUGGGUUCUGAGUGGCGCCGGUGGAGACUACGACCUGCUGCGCCC
Get precursor sequence
Structure
        10          20        30         40        50         
GCUCUGGCCCAGGUCUC--   UG  U          -|   U   G         UAAUG 
                   CUC  UC GCGCCACUCA AACU CGG GGCACUUUG     \
                   GAG  GG CGCGGUGAGU UUGG GUC CCGUGAAAU     U
CCCGCGUCGUCCAGCAUCA   GU  C          C^   -   G         CCAGG 
       110       100        90        80         70        60
Deep sequencing
Go to detailed chart
3' NTU Unknown
MotifsCNNC at 3p(+17)
Tissue expression
-   +
To
Star sequence

Cpo-Mir-430-P5_5p* (predicted)
mirBase accessionMIMAT0047203
Sequence 
0- ACUCAAACUUCGGGGGCACUUUG -23
Get sequence
Mature sequence

Cpo-Mir-430-P5_3p (predicted)
mirBase accessionMIMAT0047204
Sequence 
36- AAGUGCCGCUGGGUUCUGAGUGG -59
Get sequence