MirGeneDB 3.0
MirGeneDB ID

Cja-Mir-430-P5

Family name MIR-430 (all species)
Species White-tufted-ear marmoset (Callithrix jacchus)
MiRBase ID
Paralogues Cja-Mir-430-P1  Cja-Mir-430-P2  Cja-Mir-430-P3  Cja-Mir-430-P4  Cja-Mir-430-P6  Cja-Mir-430-P7  Cja-Mir-430-P8  Cja-Mir-430-P9  Cja-Mir-430-P10  Cja-Mir-430-P11 
Orthologues Bta-Mir-430-P5  Cfa-Mir-430-P5d1  Cfa-Mir-430-P5d2  Cpo-Mir-430-P5  Dno-Mir-430-P5  Eca-Mir-430-P5  Ete-Mir-430-P5  Hsa-Mir-430-P5  Laf-Mir-430-P5  Mml-Mir-430-P5  Mmr-Mir-430-P5e  Mmr-Mir-430-P5f  Mmu-Mir-430-P5a  Mmu-Mir-430-P5b  Mmu-Mir-430-P5c  Ocu-Mir-430-P5  Pab-Mir-430-P5  Rno-Mir-430-P5a  Rno-Mir-430-P5b  Rno-Mir-430-P5c  Xla-Mir-430-o5o1  Xla-Mir-430-o5o2  Xla-Mir-430-o5p1  Xla-Mir-430-o5p2  Xla-Mir-430-o5q1  Xla-Mir-430-o5q2  Xla-Mir-430-o5r  Xla-Mir-430-o5s  Xtr-Mir-430-o5a1  Xtr-Mir-430-o5a2  Xtr-Mir-430-o5a3  Xtr-Mir-430-o5a4  Xtr-Mir-430-o5a5  Xtr-Mir-430-o5a6  Xtr-Mir-430-o5a7  Xtr-Mir-430-o5a8  Xtr-Mir-430-o5a9  Xtr-Mir-430-o5a10  Xtr-Mir-430-o5a11  Xtr-Mir-430-o5a12  Xtr-Mir-430-o5a13  Xtr-Mir-430-o5a14  Xtr-Mir-430-o5a15  Xtr-Mir-430-o5a16  Xtr-Mir-430-o5a17  Xtr-Mir-430-o5a18  Xtr-Mir-430-o5a19  Xtr-Mir-430-o5a20  Xtr-Mir-430-o5a21  Xtr-Mir-430-o5a22  Xtr-Mir-430-o5a23  Xtr-Mir-430-o5b  Xtr-Mir-430-o5c1  Xtr-Mir-430-o5c2  Xtr-Mir-430-o5c3  Xtr-Mir-430-o5c4  Xtr-Mir-430-o5c5  Xtr-Mir-430-o5c6  Xtr-Mir-430-o5c7  Xtr-Mir-430-o5c8  Xtr-Mir-430-o5c9  Xtr-Mir-430-o5c10  Xtr-Mir-430-o5c11  Xtr-Mir-430-o5c12  Xtr-Mir-430-o5c13  Xtr-Mir-430-o5c14  Xtr-Mir-430-o5c15  Xtr-Mir-430-o5c16  Xtr-Mir-430-o5c17  Xtr-Mir-430-o5c18  Xtr-Mir-430-o5c19  Xtr-Mir-430-o5c20  Xtr-Mir-430-o5c21  Xtr-Mir-430-o5c22  Xtr-Mir-430-o5c23  Xtr-Mir-430-o5c24  Xtr-Mir-430-o5c25  Xtr-Mir-430-o5d1  Xtr-Mir-430-o5d2  Xtr-Mir-430-o5e  Xtr-Mir-430-o5f1  Xtr-Mir-430-o5f2  Xtr-Mir-430-o5g  Xtr-Mir-430-o5h  Xtr-Mir-430-o5j  Xtr-Mir-430-o5k1  Xtr-Mir-430-o5k2  Xtr-Mir-430-o5k3  Xtr-Mir-430-o5k4  Xtr-Mir-430-o5k5  Xtr-Mir-430-o5k6  Xtr-Mir-430-o5k7  Xtr-Mir-430-o5k8  Xtr-Mir-430-o5k9  Xtr-Mir-430-o5k10  Xtr-Mir-430-o5k11  Xtr-Mir-430-o5k12  Xtr-Mir-430-o5k13  Xtr-Mir-430-o5k14  Xtr-Mir-430-o5k15  Xtr-Mir-430-o5k16  Xtr-Mir-430-o5k17  Xtr-Mir-430-o5k18  Xtr-Mir-430-o5k19  Xtr-Mir-430-o5k20  Xtr-Mir-430-o5k21  Xtr-Mir-430-o5k22  Xtr-Mir-430-o5k23  Xtr-Mir-430-o5k24  Xtr-Mir-430-o5k25  Xtr-Mir-430-o5k26  Xtr-Mir-430-o5k27  Xtr-Mir-430-o5l1  Xtr-Mir-430-o5l2  Xtr-Mir-430-o5l3  Xtr-Mir-430-o5l4  Xtr-Mir-430-o5l5  Xtr-Mir-430-o5l6  Xtr-Mir-430-o5l7  Xtr-Mir-430-o5l8  Xtr-Mir-430-o5l9  Xtr-Mir-430-o5l10  Xtr-Mir-430-o5l11  Xtr-Mir-430-o5l12  Xtr-Mir-430-o5l13  Xtr-Mir-430-o5l14  Xtr-Mir-430-o5l15  Xtr-Mir-430-o5l16  Xtr-Mir-430-o5l17  Xtr-Mir-430-o5l18  Xtr-Mir-430-o5l19  Xtr-Mir-430-o5m  Xtr-Mir-430-o5n1  Xtr-Mir-430-o5n2 
Node of Origin (locus) Eutheria
Node of Origin (family) Vertebrata
Genome context
(GCA_011100555.2_mCalJa1.2.pat.X_genomic)		 CM021936.1: 45626210-45626266 [+] UCSC Ensembl
Clustered miRNAs
(< 50kb from Mir-430-P5)		 Mir-430-P5 CM021936.1: 45626210-45626266 [+] UCSC Ensembl
Mir-430-P6 CM021936.1: 45626413-45626471 [+] UCSC Ensembl
Mir-430-P7 CM021936.1: 45627844-45627904 [+] UCSC Ensembl
Seed CUCAAAC
Precursor
(pre-Mir +30nt flank)		 
GCGUCCUUCCGCUGCCCCUCGGCCUGUGCCACUCAAACUGUGGGGGCACUUUCUGUUCUGGUGAAAGUGCCGCCAUUUUUUGAGUGUUACCGACUGUGGAAACUCAACUUGGGGGGA
Get precursor sequence
Structure
        10          20        30        40        50        
GCGUCCUUCCGCUGCCC--|U   CCU   C        CU    G         UGUU 
                   C CGG   GUG CACUCAAA  GUGG GGCACUUUC    \
                   G GUC   CAU GUGAGUUU  UACC CCGUGAAAG    C
AGGGGGGUUCAACUCAAAG^U   AGC   U        UU    G         UGGU 
     110       100        90        80        70        60
Deep sequencing
3' NTU Unknown
MotifsCNNC at 3p(+17), UGUG in loop
Tissue expression
- +
To
Mature sequence

Cja-Mir-430-P5_5p (predicted)
mirBase accessionNone
Sequence 
0- ACUCAAACUGUGGGGGCACUUUC -23
Get sequence
Star sequence

Cja-Mir-430-P5_3p* (predicted)
mirBase accessionNone
Sequence 
34- AAGUGCCGCCAUUUUUUGAGUGU -57
Get sequence