| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-430-P5c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-430 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-293 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mmu-Mir-430-P1 Mmu-Mir-430-P2 Mmu-Mir-430-P3 Mmu-Mir-430-P4 Mmu-Mir-430-P5a Mmu-Mir-430-P5b Mmu-Mir-430-P6 Mmu-Mir-430-P7a Mmu-Mir-430-P7b Mmu-Mir-430-P7c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-430-P5 Cja-Mir-430-P5 Cpo-Mir-430-P5 Dno-Mir-430-P5 Eca-Mir-430-P5 Ete-Mir-430-P5 Hsa-Mir-430-P5 Laf-Mir-430-P5 Mml-Mir-430-P5 Ocu-Mir-430-P5 Pab-Mir-430-P5 Rno-Mir-430-P5c Xtr-Mir-430-o5c1 Xtr-Mir-430-o5c2 Xtr-Mir-430-o5c3 Xtr-Mir-430-o5c4 Xtr-Mir-430-o5c5 Xtr-Mir-430-o5c6 Xtr-Mir-430-o5c7 Xtr-Mir-430-o5c8 Xtr-Mir-430-o5c9 Xtr-Mir-430-o5c10 Xtr-Mir-430-o5c11 Xtr-Mir-430-o5c12 Xtr-Mir-430-o5c13 Xtr-Mir-430-o5c14 Xtr-Mir-430-o5c15 Xtr-Mir-430-o5c16 Xtr-Mir-430-o5c17 Xtr-Mir-430-o5c18 Xtr-Mir-430-o5c19 Xtr-Mir-430-o5c20 Xtr-Mir-430-o5c21 Xtr-Mir-430-o5c22 Xtr-Mir-430-o5c23 Xtr-Mir-430-o5c24 Xtr-Mir-430-o5c25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Muridae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr7: 3220356-3220411 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-430-P5c) |
Mir-430-P5a
chr7: 3218639-3218697 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-430-P7a chr7: 3218932-3218989 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P5b chr7: 3219200-3219261 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P7b chr7: 3219494-3219550 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P5c chr7: 3220356-3220411 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P7c chr7: 3220655-3220712 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P6 chr7: 3220779-3220837 [+] UCSC Ensembl |
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| Seed | GUGCCGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GGUCCCUGUGGAAAUGCUUCAAUCUGUGGUACUCAAACUGUGUGACAUUUUGUUCUUUGUAAGAAGUGCCGCAGAGUUUGUAGUGUUGCCGAUUGAGAAACUGCAGUUGGCCUAAGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GGUCCCUGUGGAAAUGC-- U GG -| G A GUUCU UUCAAUC GU UACU CAAACU UGUG CAUUUU \ GAGUUAG CG GUGA GUUUGA ACGC GUGAAG U GAAUCCGGUUGACGUCAAA C UU U^ G C AAUGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mmu-Mir-430-P5c_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0004573 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACUCAAACUGUGUGACAUUUU -21
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004573 TargetScanVert: mmu-miR-293-5p miRDB: MIMAT0004573 |
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| Mature sequence | Mmu-Mir-430-P5c_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0000371 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
34- AGUGCCGCAGAGUUUGUAGUGU -56
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000371 TargetScanVert: mmu-miR-293-3p miRDB: MIMAT0000371 |
