| MirGeneDB ID | Mmr-Mir-430-P5f | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-430 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mmr-Mir-430-P1 Mmr-Mir-430-P2 Mmr-Mir-430-P3 Mmr-Mir-430-P4 Mmr-Mir-430-P5e Mmr-Mir-430-P6 Mmr-Mir-430-P7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-430-P5 Cja-Mir-430-P5 Cpo-Mir-430-P5 Dno-Mir-430-P5 Eca-Mir-430-P5 Ete-Mir-430-P5 Hsa-Mir-430-P5 Laf-Mir-430-P5 Mml-Mir-430-P5 Ocu-Mir-430-P5 Pab-Mir-430-P5 Xtr-Mir-430-o5f1 Xtr-Mir-430-o5f2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | M. murinus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007682.1: 10860566-10860624 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-430-P5f) |
Mir-430-P5f
CM007682.1: 10860566-10860624 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-430-P6 CM007682.1: 10860739-10860798 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P7 CM007682.1: 10861205-10861262 [+] UCSC Ensembl |
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| Seed | AGUGCCG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CUUCCCUAGUGGCUCCUUCCGACCUGUGGCACUCAAACUGUGGGGGCACUUUCUGUUAUGUGACGAAAGUGCCGCUACUUUUUGAGUGUUACCGAUUGAGAAAACUCGACCGGCAAAUAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CUUCCCUAGUGGCUCCU- -| CCU CU G UGUUA UC CGA GUGGCACUCAAA GUGG GGCACUUUC \ AG GUU CAUUGUGAGUUU CAUC CCGUGAAAG U AUAAACGGCCAGCUCAAA A^ AGC UU G CAGUG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mmr-Mir-430-P5f_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACUCAAACUGUGGGGGCACUUUC -23
Get sequence
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| Mature sequence | Mmr-Mir-430-P5f_3p (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- AAGUGCCGCUACUUUUUGAGUGU -59
Get sequence
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