MirGeneDB 3.0
80 microRNA genes of family MIR-101
Sort by genome coordinates Motifs
MirGeneDB ID ▼ MiRBase ID Family Seed 5p accession 3p accession Chromosome Start End Strand Node of origin (locus) Node of origin (family) Iso­miR 3' NTU  UG  UGUG CNNC
Xla-Mir-101-P2b V None MIR-101 ACAGUAC None None NW_016694889.1 314986 315044 - X. laevis Vertebrata 2 No 1 1
Xla-Mir-101-P2a V xla-mir-101 MIR-101 ACAGUAC MIMAT0046412 MIMAT0046413 NC_030724.1 125355859 125355917 - X. laevis Vertebrata 2 No 1
Xtr-Mir-101-P2 V xtr-mir-101a-1 MIR-101 ACAGUAC None MIMAT0003662 chr1 115031351 115031409 - Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1
Tni-Mir-101-P2 V tni-mir-101b MIR-101 ACAGUAC None MIMAT0003040 4 1028860 1028918 + Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1
Tgu-Mir-101-P2 V tgu-mir-101-1 MIR-101 ACAGUAC MIMAT0031101 MIMAT0014508 Z 68899072 68899130 + Vertebrata Vertebrata 2 No 1
Sto-Mir-101-P2 V None MIR-101 ACAGUAC None None BFAA01004869.1 93866 93924 + Vertebrata Vertebrata 2 No 1
Sha-Mir-101-P2 V None MIR-101 ACAGUAC None None GL841562.1 1424390 1424448 + Vertebrata Vertebrata 2 No 1
Rno-Mir-101-P2 V rno-mir-101b MIR-101 ACAGUAC MIMAT0017045 MIMAT0000615 chr1 247263746 247263804 + Vertebrata Vertebrata 2 No 1
Pbv-Mir-101-P2 V pbv-mir-101-2 MIR-101 ACAGUAC MIMAT0038903 MIMAT0038902 KE954797.1 126581 126639 - Vertebrata Vertebrata 2 No 1
Pab-Mir-101-P2 V None MIR-101 ACAGUAC None None CM054692.2 53818388 53818446 - Vertebrata Vertebrata 2 No 1
Ocu-Mir-101-P2 V ocu-mir-101-2 MIR-101 ACAGUAC MIMAT0048188 MIMAT0048187 chr1 49384671 49384729 - Vertebrata Vertebrata 2 No 1
Oan-Mir-101-P2 V oan-mir-101-2 MIR-101 ACAGUAC None MIMAT0007011 NC_041753.1 52495166 52495224 - Vertebrata Vertebrata 2 No 1
Neu-Mir-101-P2 V None MIR-101 ACAGUAC None None CM051813.1 39793866 39793924 - Vertebrata Vertebrata 2 No 1
Mun-Mir-101-P2 V None MIR-101 ACAGUAC None None LR594633.1 234314546 234314604 - Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1
Mmu-Mir-101-P2 V mmu-mir-101b MIR-101 ACAGUAC MIMAT0017046 MIMAT0000616 chr19 29135302 29135360 + Vertebrata Vertebrata 2 No 1
Mmr-Mir-101-P2 V mmr-mir-101-2 MIR-101 ACAGUAC None MIMAT0049165 CM007670.1 26908064 26908122 - Vertebrata Vertebrata 2 No 1
Mml-Mir-101-P2 V mml-mir-101-2 MIR-101 ACAGUAC MIMAT0031100 MIMAT0002431 CM014350.1 78991107 78991165 - Vertebrata Vertebrata 2 No 1
Mdo-Mir-101-P2 V mdo-mir-101-2 MIR-101 ACAGUAC MIMAT0026657 MIMAT0004098 6 166669177 166669235 + Vertebrata Vertebrata 2 No 1
Mal-Mir-101-P2 V None MIR-101 ACAGUAC None None KV884763.1 1469811 1469869 + Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1
Loc-Mir-101-P2 V None MIR-101 ACAGUAC None None LG2 37364265 37364323 - Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1
Laf-Mir-101-P2 V None MIR-101 ACAGUAC None None GL010115.1 848349 848407 - Vertebrata Vertebrata 2 No 1
Hsa-Mir-101-P2 V hsa-mir-101-2 MIR-101 ACAGUAC MIMAT0037312 MIMAT0000099 chr9 4850308 4850366 + Vertebrata Vertebrata 2 No 1
Gmo-Mir-101-P2 V gmo-mir-101b MIR-101 ACAGUAC MIMAT0044231 MIMAT0044232 GeneScaffold_3576 29659 29717 + Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1
Gja-Mir-101-P2 V None MIR-101 ACAGUAC None None NW_015163623.1 608902 608960 - Vertebrata Vertebrata 2 No 1
Gga-Mir-101-P2 V gga-mir-101-1 MIR-101 ACAGUAC MIMAT0026545 MIMAT0001185 Z 27510598 27510656 + Vertebrata Vertebrata 2 No 1
Ete-Mir-101-P2 V None MIR-101 ACAGUAC None None JH980382 6713736 6713794 + Vertebrata Vertebrata 2 No 1
Eca-Mir-101-P2 V eca-mir-101-2 MIR-101 ACAGUAC None MIMAT0012951 CM009170.1 25728398 25728456 + Vertebrata Vertebrata 2 No 1
Dre-Mir-101-P2 V dre-mir-101b MIR-101 ACAGUAC None MIMAT0001815 chr5 1837176 1837234 - Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1 1
Dno-Mir-101-P2 V dno-mir-101-2 MIR-101 ACAGUAC MIMAT0047600 MIMAT0047599 JH567481 2307391 2307449 - Vertebrata Vertebrata 2 No 1
Cpo-Mir-101-P2 V cpo-mir-101-2 MIR-101 ACAGUAC MIMAT0046949 MIMAT0046948 scaffold_21 15000495 15000553 - Vertebrata Vertebrata 2 No 1
Cpi-Mir-101-P2 V cpi-mir-101-2 MIR-101 ACAGUAC MIMAT0037718 MIMAT0037717 JH584680 13719006 13719064 + Vertebrata Vertebrata 2 No 1
Cmi-Mir-101-P2 V None MIR-101 ACAGUAC None None KI635975.1 375730 375787 - Vertebrata Vertebrata 2 No 1
Cli-Mir-101-P2 V cli-mir-101-2 MIR-101 ACAGUAC MIMAT0038484 MIMAT0038483 scaffold6 3523034 3523092 - Vertebrata Vertebrata 2 No 1
Cja-Mir-101-P2 V None MIR-101 ACAGUAC None None CM021915.1 108313218 108313276 + Vertebrata Vertebrata 2 No 1
Cfa-Mir-101-P2 V cfa-mir-101-2 MIR-101 ACAGUAC None MIMAT0006600 chr1 93194326 93194384 + Vertebrata Vertebrata 2 No 1
Bta-Mir-101-P2 V bta-mir-101-2 MIR-101 ACAGUAC None MIMAT0003520 NC_037335.1 39689038 39689096 - Vertebrata Vertebrata 2 No 1
Ami-Mir-101-P2 V ami-mir-101-2 MIR-101 ACAGUAC MIMAT0038118 MIMAT0038117 NW_017713772.1 32263711 32263769 + Vertebrata Vertebrata 2 No 1
Aca-Mir-101-P2 V aca-mir-101-2 MIR-101 ACAGUAC MIMAT0021712 MIMAT0021711 2 52137657 52137715 + Vertebrata Vertebrata 2 No 1
Spt-Mir-101-P2 None MIR-101 ACAGUAC None None QEPC01011191.1 4589436 4589494 - Vertebrata Vertebrata Unknown 1
Lch-Mir-101-P2 None MIR-101 ACAGUAC None None JH129674.1 173917 173975 + Vertebrata Vertebrata Unknown 1 1
Spt-Mir-101-P1d None MIR-101 ACAGUAC None None QEPC01013865.1 24500970 24501028 - S. punctatus Vertebrata Unknown 1 1
Spt-Mir-101-P1c None MIR-101 ACAGUAC None None QEPC01013865.1 24503586 24503644 - S. punctatus Vertebrata Unknown 1 1
Xla-Mir-101-P1b V None MIR-101 ACAGUAC None None NC_030731.1 58882293 58882351 + X. laevis Vertebrata 2 No 1 1
Xla-Mir-101-P1a V None MIR-101 ACAGUAC None None NC_030730.1 73858577 73858635 + X. laevis Vertebrata 2 No 1 1
Xtr-Mir-101-P1 V xtr-mir-101a-2 MIR-101 ACAGUAC None MIMAT0003662 chr4 79102563 79102621 - Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1
Tni-Mir-101-P1 V tni-mir-101a MIR-101 ACAGUAC None MIMAT0002903 1 20355621 20355679 + Vertebrata Vertebrata 2 No
Tgu-Mir-101-P1 V tgu-mir-101-2 MIR-101 ACAGUAC MIMAT0014631 MIMAT0014508 8 1553620 1553678 + Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1
Sto-Mir-101-P1 V None MIR-101 ACAGUAC None None BFAA01000061.1 1365251 1365309 - Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1
Sha-Mir-101-P1 V sha-mir-101 MIR-101 ACAGUAC None MIMAT0022811 GL856736.1 1265481 1265539 + Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1
Rno-Mir-101-P1 V rno-mir-101a MIR-101 ACAGUAC MIMAT0004726 MIMAT0000823 chr5 120168444 120168502 - Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1
Pbv-Mir-101-P1 V pbv-mir-101-1 MIR-101 ACAGUAC MIMAT0038901 MIMAT0038902 KE954279.1 114044 114102 - Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1
Pab-Mir-101-P1 V None MIR-101 ACAGUAC None None CM054679.2 168068139 168068197 + Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1
Ocu-Mir-101-P1 V ocu-mir-101-1 MIR-101 ACAGUAC MIMAT0048186 MIMAT0048187 chr13 101340538 101340596 + Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1
Oan-Mir-101-P1 V oan-mir-101-1 MIR-101 ACAGUAC None MIMAT0007011 NC_041745.1 41083106 41083164 + Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1
Mun-Mir-101-P1 V None MIR-101 ACAGUAC None None LR594637.1 42114323 42114381 - Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1
Mmu-Mir-101-P1 V mmu-mir-101a MIR-101 ACAGUAC MIMAT0004526 MIMAT0000133 chr4 101346956 101347014 - Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1
Mmr-Mir-101-P1 V mmr-mir-101-1 MIR-101 ACAGUAC None MIMAT0049165 CM007662.1 1257472 1257530 - Vertebrata Vertebrata 2 No 1
Mml-Mir-101-P1 V mml-mir-101-1 MIR-101 ACAGUAC MIMAT0026581 MIMAT0002431 CM014336.1 159372686 159372744 + Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1
Mdo-Mir-101-P1 V mdo-mir-101-1 MIR-101 ACAGUAC MIMAT0031076 MIMAT0004098 2 26267875 26267933 + Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1
Mal-Mir-101-P1 V None MIR-101 ACAGUAC None None KV884746.1 1742489 1742547 - Vertebrata Vertebrata 2 No
Loc-Mir-101-P1 V None MIR-101 ACAGUAC None None LG10 10266778 10266836 - Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1
Laf-Mir-101-P1 V None MIR-101 ACAGUAC None None GL010044.1 29122928 29122986 + Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1
Hsa-Mir-101-P1 V hsa-mir-101-1 MIR-101 ACAGUAC MIMAT0004513 MIMAT0000099 chr1 65058441 65058499 - Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1
Gmo-Mir-101-P1 V gmo-mir-101a MIR-101 ACAGUAC MIMAT0044119 MIMAT0044120 GeneScaffold_1472 99849 99907 - Vertebrata Vertebrata 2 No 1
Gja-Mir-101-P1 V None MIR-101 ACAGUAC None None NW_015177048.1 96034 96092 + Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1
Gga-Mir-101-P1 V gga-mir-101-2 MIR-101 ACAGUAC MIMAT0031077 MIMAT0001185 8 28612656 28612714 - Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1
Ete-Mir-101-P1 V None MIR-101 ACAGUAC None None JH980298 60204639 60204697 + Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1
Eca-Mir-101-P1 V eca-mir-101-1 MIR-101 ACAGUAC None MIMAT0012951 CM009152.1 92613112 92613170 + Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1
Dre-Mir-101-P1 V dre-mir-101a MIR-101 ACAGUAC None MIMAT0001814 chr6 31365458 31365516 + Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1
Dno-Mir-101-P1 V dno-mir-101-1 MIR-101 ACAGUAC MIMAT0047598 MIMAT0047599 JH582969 1484135 1484193 - Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1
Cpo-Mir-101-P1 V cpo-mir-101-1 MIR-101 ACAGUAC MIMAT0046947 MIMAT0046948 scaffold_2 67531172 67531230 + Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1
Cpi-Mir-101-P1 V cpi-mir-101-1 MIR-101 ACAGUAC MIMAT0037716 MIMAT0037717 JH584706 839802 839860 - Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1
Cmi-Mir-101-P1 V None MIR-101 ACAGUAC None None KI635887.1 6427947 6428005 + Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1
Cli-Mir-101-P1 V cli-mir-101-1 MIR-101 ACAGUAC MIMAT0038482 MIMAT0038483 scaffold7 15720708 15720766 - Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1
Cja-Mir-101-P1 V None MIR-101 ACAGUAC None None CM021921.1 99374272 99374330 - Vertebrata Vertebrata 2 Yes 1 1
Cfa-Mir-101-P1 V cfa-mir-101-1 MIR-101 ACAGUAC None MIMAT0006600 chr5 45184772 45184830 + Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1
Bta-Mir-101-P1 V bta-mir-101-1 MIR-101 ACAGUAC None MIMAT0003520 NC_037330.1 80335449 80335507 + Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1
Ami-Mir-101-P1 V ami-mir-101-1 MIR-101 ACAGUAC MIMAT0038116 MIMAT0038117 NW_017710321.1 12121219 12121277 + Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1
Aca-Mir-101-P1 V aca-mir-101-1 MIR-101 ACAGUAC MIMAT0021710 MIMAT0021711 4 98411454 98411512 + Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1
Lch-Mir-101-P1 None MIR-101 ACAGUAC None None JH130703.1 86604 86662 - Vertebrata Vertebrata Unknown 1

(red - mature/co-mature, blue - star)

Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all