| MirGeneDB ID | Sto-Mir-430-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-430 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Cloudy Catshark (Scyliorhinus torazame) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Sto-Mir-430-P1 Sto-Mir-430-P2 Sto-Mir-430-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Ami-Mir-430-P4 Bta-Mir-430-P4 Cfa-Mir-430-P4 Cja-Mir-430-P4 Cli-Mir-430-P4 Cmi-Mir-430-P4 Cpi-Mir-430-P4 Cpo-Mir-430-P4 Dno-Mir-430-P4 Eca-Mir-430-P4 Ete-Mir-430-P4 Gga-Mir-430-P4 Hsa-Mir-430-P4 Laf-Mir-430-P4 Mdo-Mir-430-P4 Mml-Mir-430-P4 Mmr-Mir-430-P4 Mmu-Mir-430-P4 Oan-Mir-430-P4 Ocu-Mir-430-P4 Pab-Mir-430-P4 Rno-Mir-430-P4 Spt-Mir-430-P4 Tgu-Mir-430-P4 Xla-Mir-430-o4a Xla-Mir-430-o4b Xtr-Mir-430-o4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_003427355_STO_add) |
BFAA01002990.1: 216824-216879 [-] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-430-P4) |
Mir-430-P4
BFAA01002990.1: 216824-216879 [-]
Mir-430-P3 BFAA01002990.1: 217072-217132 [-] Mir-430-P2 BFAA01002990.1: 217783-217842 [-] Mir-92-P2a BFAA01002990.1: 218057-218115 [-] Mir-430-P1 BFAA01002990.1: 218430-218489 [-] |
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| Seed | CUCUAAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AGUCUUUUCCAAUGGAAUUGUGAAGUGGAGCCUCUAACAUGUGAGAACUUGCUCUCAUUGAAGUAAGUGCUCGCUUGUUGGGAUUUCUACUGCUCAACAGUACAACUUUUGAGAACGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 AGUCUUUUCCAAUGGAA--| UGA CC U A UCUC UUG AGUGGAG UCUAACA GUGAG ACUUGC A AAC UCAUCUU GGGUUGU CGCUC UGAAUG U CAAGAGUUUUCAACAUGAC^ UCG UA U G AAGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Sto-Mir-430-P4_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CCUCUAACAUGUGAGAACUUGC -22
Get sequence
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| Co-mature sequence | Sto-Mir-430-P4_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
33- UAAGUGCUCGCUUGUUGGGAUUU -56
Get sequence
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