MirGeneDB ID | Pbv-Mir-1329 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-1329 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Burmese python (Python bivittatus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | pbv-mir-1329 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aca-Mir-1329-v1 Ami-Mir-1329 Bta-Mir-1329 Cli-Mir-1329-v1 Cmi-Mir-1329 Cpi-Mir-1329-v1 Ebu-Mir-1329 Eca-Mir-1329 Gga-Mir-1329-v1 Gja-Mir-1329-v1 Laf-Mir-1329 Mdo-Mir-1329 Mmr-Mir-1329 Mun-Mir-1329 Neu-Mir-1329 Oan-Mir-1329-v1 Pma-Mir-1329 Sha-Mir-1329 Spt-Mir-1329 Sto-Mir-1329 Tgu-Mir-1329-v1 Xla-Mir-1329-P1 Xla-Mir-1329-P2 Xtr-Mir-1329 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_000186305.2_Python_molurus_bivittatus) |
KE953287.1: 192177-192237 [-] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | ACAGUGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UAGAGUUGAGCCCACAUCUGGUUGUAGGGGUACAGUGAUCAGGUUACGACGGAUUUCUCUAGUAACAACCCCGUAGCUUGAUCACCAUCUCCCUAUGACUCAGAUAACUGCAGGUUUGCCUGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 UAGAGUUGAGCCCACAU- -| UG UACA AC AUUUCUC CUG GU UAGGGG GUGAUCAGGUUACG GG U GAC CA AUCCCU CACUAGUUCGAUGC CC A UCCGUUUGGACGUCAAUA U^ GU CUAC C- AACAAUG . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Pbv-Mir-1329_5p (predicted) |
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mirBase accession | MIMAT0039075 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UACAGUGAUCAGGUUACGACGGA -23
Get sequence
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Star sequence | Pbv-Mir-1329_3p* (predicted) |
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mirBase accession | MIMAT0039076 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
39- CCCGUAGCUUGAUCACCAUCUC -61
Get sequence
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