| MirGeneDB ID | Mmr-Mir-148-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-148 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmr-mir-152 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mmr-Mir-148-P1 Mmr-Mir-148-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Ami-Mir-148-P3 Bta-Mir-148-P3 Cfa-Mir-148-P3 Cja-Mir-148-P3 Cmi-Mir-148-P3 Cpi-Mir-148-P3 Cpo-Mir-148-P3 Dno-Mir-148-P3 Dre-Mir-148-P3 Ebu-Mir-148 Eca-Mir-148-P3 Gmo-Mir-148-P3 Hsa-Mir-148-P3 Laf-Mir-148-P3 Loc-Mir-148-P3 Mal-Mir-148-P3 Mdo-Mir-148-P3 Mml-Mir-148-P3 Mmu-Mir-148-P3 Neu-Mir-148-P3 Oan-Mir-148-P3 Ocu-Mir-148-P3 Pab-Mir-148-P3 Rno-Mir-148-P3 Sha-Mir-148-P3 Spt-Mir-148-P3 Sto-Mir-148-P3 Tni-Mir-148-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007676.1: 26922037-26922097 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CAGUGCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GAGGAGGCUCGGCCCGCUGUCCCCCCGGCCCAGGUUCUGUGAUACACUCUGACUCGGGCUCUGGAGCAGUCAGUGCAUGACAGAACUUGGGCCCGGAAGGACCUUCUGCACCCAACGGGCAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 GAGGAGGCUCGGCCCGCU- CC -| G A CU CGGGCU GUCC CC GGCCCAGGUUCUGU AU CACU GACU \ CAGG GG CCGGGUUCAAGACA UA GUGA CUGA C ACGGGCAACCCACGUCUUC AA C^ G C -- CGAGGU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| Comment | There is a second Drosha cut +1 on both arms. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mmr-Mir-148-P3_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0049147 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CAGGUUCUGUGAUACACUCUGACU -24
Get sequence
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| Mature sequence | Mmr-Mir-148-P3_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- UCAGUGCAUGACAGAACUUGGG -61
Get sequence
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