MirGeneDB ID | Hsa-Mir-430-P50 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Family name | MIR-430 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UACAAAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Human (Homo sapiens) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | hsa-mir-1283-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Hsa-Mir-430-P1 Hsa-Mir-430-P2 Hsa-Mir-430-P3 Hsa-Mir-430-P4 Hsa-Mir-430-P5 Hsa-Mir-430-P6 Hsa-Mir-430-P7 Hsa-Mir-430-P8a Hsa-Mir-430-P8b Hsa-Mir-430-P9a Hsa-Mir-430-P9b Hsa-Mir-430-P10 Hsa-Mir-430-P11 Hsa-Mir-430-P12 Hsa-Mir-430-P13 Hsa-Mir-430-P14 Hsa-Mir-430-P15 Hsa-Mir-430-P16 Hsa-Mir-430-P17 Hsa-Mir-430-P18 Hsa-Mir-430-P19 Hsa-Mir-430-P20 Hsa-Mir-430-P21 Hsa-Mir-430-P22 Hsa-Mir-430-P23 Hsa-Mir-430-P24 Hsa-Mir-430-P25 Hsa-Mir-430-P26 Hsa-Mir-430-P27a Hsa-Mir-430-P27b Hsa-Mir-430-P29a Hsa-Mir-430-P29b Hsa-Mir-430-P31a Hsa-Mir-430-P31b Hsa-Mir-430-P33 Hsa-Mir-430-P34 Hsa-Mir-430-P35a Hsa-Mir-430-P35b Hsa-Mir-430-P35c Hsa-Mir-430-P38 Hsa-Mir-430-P39 Hsa-Mir-430-P41 Hsa-Mir-430-P42 Hsa-Mir-430-P43 Hsa-Mir-430-P44 Hsa-Mir-430-P45 Hsa-Mir-430-P46 Hsa-Mir-430-P47 Hsa-Mir-430-P48 Hsa-Mir-430-P49 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | H. sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (hg38) |
chr19: 53758246-53758304 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-430-P50) |
Mir-430-P11
chr19: 53708759-53708817 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-430-P43 chr19: 53711017-53711075 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P35a chr19: 53712282-53712342 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P19 chr19: 53713361-53713422 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P29b chr19: 53716608-53716668 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P24 chr19: 53720111-53720170 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P35b chr19: 53721081-53721139 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P27b chr19: 53722182-53722241 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P34 chr19: 53725457-53725514 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P46 chr19: 53726928-53726982 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P13 chr19: 53729853-53729911 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P38 chr19: 53731019-53731078 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P12 chr19: 53734892-53734950 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P33 chr19: 53736860-53736922 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P39 chr19: 53739348-53739407 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P35c chr19: 53741332-53741390 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P27a chr19: 53742528-53742587 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P29a chr19: 53748650-53748710 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P41 chr19: 53751226-53751285 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P15 chr19: 53752410-53752470 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P48 chr19: 53754031-53754089 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P31a chr19: 53756756-53756818 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P50 chr19: 53758246-53758304 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P31b chr19: 53761148-53761210 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P16 chr19: 53762358-53762418 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P5 chr19: 53787680-53787738 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P6 chr19: 53787895-53787953 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P7 chr19: 53788710-53788770 [+] UCSC Ensembl |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GCUGGAGCAAGAAGAUCUCAAGCUGUGAGUCUACAAAGGAAAGCGCUUUCUGUUGUCUGAAAGAAAAGAAAUCGCUUCCCUUUGGAGUGUUACGGUUUGAGAAAAGCAGCGUUGAAGUUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 GCUGGAGCAAGAAGAUC--| GU A A C GUUGUCU UCAAGCUGUGA CU CAAAGG AAGCG UUUCU \ AGUUUGGCAUU GA GUUUCC UUCGC AAAGA G UUGAAGUUGCGACGAAAAG^ GU G C U AAAGAAA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mature sequence | Hsa-Mir-430-P50_5p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | MIMAT0005799 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CUACAAAGGAAAGCGCUUUCU -21
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0005799 TargetScanVert: hsa-miR-1283 TargetMiner: hsa-miR-1283 miRDB: MIMAT0005799 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Star sequence | Hsa-Mir-430-P50_3p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- AAAUCGCUUCCCUUUGGAGUG -59
Get sequence
|