MirGeneDB ID | Hsa-Mir-21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-21 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Human (Homo sapiens) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | hsa-mir-21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aca-Mir-21 Ami-Mir-21 Bta-Mir-21 Cfa-Mir-21 Cja-Mir-21 Cli-Mir-21 Cmi-Mir-21 Cpi-Mir-21 Cpo-Mir-21 Dno-Mir-21 Dre-Mir-21-P1 Dre-Mir-21-P2 Ebu-Mir-21 Eca-Mir-21 Ete-Mir-21 Gga-Mir-21 Gja-Mir-21 Gmo-Mir-21-P1 Gmo-Mir-21-P2 Laf-Mir-21 Lch-Mir-21 Loc-Mir-21 Mal-Mir-21-P1 Mal-Mir-21-P2 Mdo-Mir-21 Mml-Mir-21 Mmr-Mir-21 Mmu-Mir-21 Mun-Mir-21 Neu-Mir-21 Oan-Mir-21 Ocu-Mir-21 Pab-Mir-21 Pbv-Mir-21 Pma-Mir-21 Rno-Mir-21 Sha-Mir-21 Spt-Mir-21 Sto-Mir-21 Tgu-Mir-21 Tni-Mir-21-P1 Tni-Mir-21-P2 Xla-Mir-21-P3 Xla-Mir-21-P4 Xtr-Mir-21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (hg38) |
chr17: 59841273-59841332 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AGCUUAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
ACAUCUCCAUGGCUGUACCACCUUGUCGGGUAGCUUAUCAGACUGAUGUUGACUGUUGAAUCUCAUGGCAACACCAGUCGAUGGGCUGUCUGACAUUUUGGUAUCUUUCAUCUGACCAUCGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 ACAUCUCCAUGGCUGUA--| CCU GU A A A GUUGA CCA UGUCGG AGCUUAUC GACUG UGUUG CU A GGU ACAGUC UCGGGUAG CUGAC ACAAC GG U CUACCAGUCUACUUUCUAU^ UUU UG - C - UACUC . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Hsa-Mir-21_5p |
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mirBase accession | MIMAT0000076 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UAGCUUAUCAGACUGAUGUUGACU -24
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000076 TargetScanVert: hsa-miR-21-5p TargetMiner: hsa-miR-21-5p miRDB: MIMAT0000076 |
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Star sequence | Hsa-Mir-21_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0004494 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- CAACACCAGUCGAUGGGCUGUC -60
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004494 TargetScanVert: hsa-miR-21-3p TargetMiner: hsa-miR-21-3p miRDB: MIMAT0004494 |