| MirGeneDB ID | Dan-Mir-210 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-210 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila ananassae) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dan-mir-210 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-210-v1 Aca-Mir-210 Aga-Mir-210-v1 Agr-Mir-210 Ami-Mir-210 Bfl-Mir-210 Bge-Mir-210-v1 Bla-Mir-210 Bta-Mir-210 Cfa-Mir-210 Cja-Mir-210 Cli-Mir-210 Cmi-Mir-210 Cpi-Mir-210 Cpo-Mir-210 Dgr-Mir-210 Dlo-Mir-210-v1 Dma-Mir-210 Dme-Mir-210-v1 Dmo-Mir-210-v1 Dno-Mir-210 Dpu-Mir-210 Dre-Mir-210 Dsi-Mir-210-v1 Dya-Mir-210-v1 Eba-Mir-210 Ebu-Mir-210 Eca-Mir-210 Egr-Mir-210 Ete-Mir-210 Gga-Mir-210 Gja-Mir-210 Gmo-Mir-210 Gpa-Mir-210-v1 Hsa-Mir-210 Isc-Mir-210 Lan-Mir-210 Lch-Mir-210 Lgi-Mir-210 Lhy-Mir-210 Llo-Mir-210 Loc-Mir-210 Mal-Mir-210 Mdo-Mir-210 Mgi-Mir-210 Mml-Mir-210 Mmr-Mir-210 Mmu-Mir-210 Mom-Mir-210 Mun-Mir-210 Neu-Mir-210 Npo-Mir-210 Oan-Mir-210 Ocu-Mir-210 Ofu-Mir-210 Pab-Mir-210 Pau-Mir-210 Pbv-Mir-210 Pca-Mir-210 Pma-Mir-210 Pmi-Mir-210-v1 Rno-Mir-210 Sha-Mir-210 Sko-Mir-210 Sma-Mir-210 Snu-Mir-210 Spt-Mir-210 Spu-Mir-210-v1 Tca-Mir-210-v1 Tgu-Mir-210 Tni-Mir-210 War-Mir-210 Xtr-Mir-210 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Dana_caf1) |
scaffold_13335: 1604034-1604092 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-210-v1) |
Mir-210-v1
scaffold_13335: 1604034-1604092 [-]
Ensembl
Mir-210-v2 scaffold_13335: 1604034-1604092 [-] Ensembl Mir-969 scaffold_13335: 1608001-1608062 [-] Ensembl |
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| Variant | Dan-Mir-210-v1 |
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| Seed | UGUGCGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GAUUCAACGAGCGUUAACGGUGCUUAUUGCAGCUGCUGGCCACUGCACAAGAUUAGACUUAAGACUCUUGUGCGUGUGACAGCGGCUAUUGUAAGAGGCCAUAGAAGCAACCAAUCAACGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GAUUCAACGAGCGUUAAC- G-| UGC GC - UUAGAC GGU CUUAU AGCUGCUG CAC UGCACAAGA \ CCG GAAUG UCGGCGAC GUG GCGUGUUCU U CAACUAACCAACGAAGAUA GA^ UUA A- U CAGAAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dan-Mir-210-v1_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGCUGCUGGCCACUGCACAAGA -22
Get sequence
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| Mature sequence | Dan-Mir-210-v1_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0008433 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- UUGUGCGUGUGACAGCGGCUAU -59
Get sequence
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| Variant | Dan-Mir-210-v2 |
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| Seed | UUGUGCG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GAUUCAACGAGCGUUAACGGUGCUUAUUGCAGCUGCUGGCCACUGCACAAGAUUAGACUUAAGACUCUUGUGCGUGUGACAGCGGCUAUUGUAAGAGGCCAUAGAAGCAACCAAUCAACGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GAUUCAACGAGCGUUAAC- G-| UGC GC - UUAGAC GGU CUUAU AGCUGCUG CAC UGCACAAGA \ CCG GAAUG UCGGCGAC GUG GCGUGUUCU U CAACUAACCAACGAAGAUA GA^ UUA A- U CAGAAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dan-Mir-210-v2_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGCUGCUGGCCACUGCACAAGAU -23
Get sequence
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| Mature sequence | Dan-Mir-210-v2_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0008433 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- CUUGUGCGUGUGACAGCGGCUAU -59
Get sequence
|
