| MirGeneDB ID | Dan-Mir-969 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-969 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila ananassae) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Dme-Mir-969 Dmo-Mir-969 Dsi-Mir-969 Dya-Mir-969 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Dana_caf1) |
scaffold_13335: 1608001-1608062 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-969) |
Mir-210-v1
scaffold_13335: 1604034-1604092 [-]
Ensembl
Mir-210-v2 scaffold_13335: 1604034-1604092 [-] Ensembl Mir-969 scaffold_13335: 1608001-1608062 [-] Ensembl |
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| Seed | AGUUCCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUUUUUUGGAAAAUAUUCUGUUUUACGUGCGAGUUCCACUAAGCAAGUUUUGAGAAUUUUUUAAAAACAAAAACUUGACACGUUGAGCUCGUCCGUGGGGCAGAUAAUGUCAGCAGUAUAUAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 UUUUUUUGGAAAAUAUU--| UG C UAAG GAGAAUUU CUGUUUUACG CGAGUUC AC CAAGUUUU U GACGGGGUGC GCUCGAG UG GUUCAAAA U AUAUAUGACGACUGUAAUA^ CU U CACA ACAAAAAU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dan-Mir-969_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GAGUUCCACUAAGCAAGUUUU -21
Get sequence
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| Co-mature sequence | Dan-Mir-969_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- AACUUGACACGUUGAGCUCGU -62
Get sequence
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