| MirGeneDB ID | Dmo-Mir-969 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-969 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila mojavensis) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Dan-Mir-969 Dme-Mir-969 Dsi-Mir-969 Dya-Mir-969 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Dmoj_caf1) |
scaffold_6473: 13724331-13724390 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-969) |
Mir-969
scaffold_6473: 13724331-13724390 [+]
Ensembl
Mir-210-v1 scaffold_6473: 13732395-13732453 [+] Ensembl Mir-210-v2 scaffold_6473: 13732395-13732453 [+] Ensembl |
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| Seed | ACUUGAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
ACCAUAUCCACAUUUGGCUGUCCUACGAGCGAGUUCCACUAAUCAAGUUUUGAGUGUUCGAAAAUCAAAAACUUGACACGUUGAGCUCGUCUGUGUGGCACAAGUUCAACAAAAGCAACAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 ACCAUAUCCACAUUUGGC--| C AG C UAA GAGUGUU UGUC UACG CGAGUUC AC UCAAGUUUU C ACGG GUGU GCUCGAG UG AGUUCAAAA G ACAACGAAAACAACUUGAAC^ U CU U CAC ACUAAAA . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dmo-Mir-969_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GAGUUCCACUAAUCAAGUUUU -21
Get sequence
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| Mature sequence | Dmo-Mir-969_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- AACUUGACACGUUGAGCUCGU -60
Get sequence
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