| MirGeneDB ID | Aga-Mir-210 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-210 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | African malaria mosquito (Anopheles gambiae) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | aga-mir-210 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-210-v1 Aca-Mir-210 Agr-Mir-210 Ami-Mir-210 Bfl-Mir-210 Bge-Mir-210-v1 Bla-Mir-210 Bta-Mir-210 Cfa-Mir-210 Cja-Mir-210 Cli-Mir-210 Cmi-Mir-210 Cpi-Mir-210 Cpo-Mir-210 Dan-Mir-210-v1 Dgr-Mir-210 Dlo-Mir-210-v1 Dma-Mir-210 Dme-Mir-210-v1 Dmo-Mir-210-v1 Dno-Mir-210 Dpu-Mir-210 Dre-Mir-210 Dsi-Mir-210-v1 Dya-Mir-210-v1 Eba-Mir-210 Ebu-Mir-210 Eca-Mir-210 Egr-Mir-210 Ete-Mir-210 Gga-Mir-210 Gja-Mir-210 Gmo-Mir-210 Gpa-Mir-210-v1 Hsa-Mir-210 Isc-Mir-210 Lan-Mir-210 Lch-Mir-210 Lgi-Mir-210 Lhy-Mir-210 Llo-Mir-210 Loc-Mir-210 Mal-Mir-210 Mdo-Mir-210 Mgi-Mir-210 Mml-Mir-210 Mmr-Mir-210 Mmu-Mir-210 Mom-Mir-210 Mun-Mir-210 Neu-Mir-210 Npo-Mir-210 Oan-Mir-210 Ocu-Mir-210 Ofu-Mir-210 Pab-Mir-210 Pau-Mir-210 Pbv-Mir-210 Pca-Mir-210 Pma-Mir-210 Pmi-Mir-210-v1 Rno-Mir-210 Sha-Mir-210 Sko-Mir-210 Sma-Mir-210 Snu-Mir-210 Spt-Mir-210 Spu-Mir-210-v1 Tca-Mir-210-v1 Tgu-Mir-210 Tni-Mir-210 War-Mir-210 Xtr-Mir-210 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCF_943734735.2_idAnoGambNW_F1_1_genomic) |
NC_064600.1: 20690540-20690597 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-210-v1) |
Mir-210-v1
NC_064600.1: 20690540-20690597 [-]
Ensembl
Mir-210-v2 NC_064600.1: 20690540-20690597 [-] Ensembl |
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| Variant | Aga-Mir-210-v1 |
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| Seed | UGUGCGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUGAAAAUGCCGAAAGAAGAAAUUCAUUGCAGCUGCUGACCACUGCACAAGAUUAGAAUGCGACUCUUGUGCGUGUGACAACGGCUAUUAUGGGUUUUCAAAAUCAUUUUAACUCAUCGet precursor sequence |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UUGAAAAUGCCGAAAGAA--| UGC C AC - UUAGA GAAAUUCAU AGCUG UG CAC UGCACAAGA A UUUUGGGUA UCGGC AC GUG GCGUGUUCU U CUACUCAAUUUUACUAAAAC^ UUA A A- U CAGCG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Aga-Mir-210-v1_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGCUGCUGACCACUGCACAAGA -22
Get sequence
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| Mature sequence | Aga-Mir-210-v1_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0001505 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- UUGUGCGUGUGACAACGGCUAU -58
Get sequence
|
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| Variant | Aga-Mir-210-v2 |
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| Seed | UUGUGCG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUGAAAAUGCCGAAAGAAGAAAUUCAUUGCAGCUGCUGACCACUGCACAAGAUUAGAAUGCGACUCUUGUGCGUGUGACAACGGCUAUUAUGGGUUUUCAAAAUCAUUUUAACUCAUCGet precursor sequence |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UUGAAAAUGCCGAAAGAA--| UGC C AC - UUAGA GAAAUUCAU AGCUG UG CAC UGCACAAGA A UUUUGGGUA UCGGC AC GUG GCGUGUUCU U CUACUCAAUUUUACUAAAAC^ UUA A A- U CAGCG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Aga-Mir-210-v2_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGCUGCUGACCACUGCACAAGAU -23
Get sequence
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| Mature sequence | Aga-Mir-210-v2_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0001505 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- CUUGUGCGUGUGACAACGGCUAU -58
Get sequence
|
