MirGeneDB ID | Aca-Mir-26-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-26 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Green anole lizard (Anolis carolinensis) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Aca-Mir-26-P1 Aca-Mir-26-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Ami-Mir-26-P4 Bta-Mir-26-P4 Cfa-Mir-26-P4 Cja-Mir-26-P4 Cpi-Mir-26-P4 Cpo-Mir-26-P4 Dno-Mir-26-P4 Dre-Mir-26-P4 Eca-Mir-26-P4 Ete-Mir-26-P4 Gga-Mir-26-P4 Gja-Mir-26-P4 Gmo-Mir-26-P4 Hsa-Mir-26-P4 Laf-Mir-26-P4 Lch-Mir-26-P4 Loc-Mir-26-P4 Mal-Mir-26-P4 Mdo-Mir-26-P4 Mml-Mir-26-P4 Mmr-Mir-26-P4 Mmu-Mir-26-P4 Mun-Mir-26-P4 Neu-Mir-26-P4 Oan-Mir-26-P4 Ocu-Mir-26-P4 Pab-Mir-26-P4 Pbv-Mir-26-P4 Pma-Mir-26-o4 Rno-Mir-26-P4 Sha-Mir-26-P4 Spt-Mir-26-P4 Sto-Mir-26-P4 Tgu-Mir-26-P4 Tni-Mir-26-P4 Xla-Mir-26-P4a Xla-Mir-26-P4b Xtr-Mir-26-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (anoCar2) |
2: 67040511-67040571 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UCAAGUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GAAGGCUAUUGCGUGAAGGCUUCAGCCUGGUUCAAGUAAUCCAGGAUAGGCUGUUACCAGGCAGUACGGCCUAUUCUUGAUUACUUGUUUCAGGAGGCGGCCCCUUGUCACAUUGAUACCAGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 GAAGGCUAUUGCGUGAA--| UCAG UU C GUUACCA GGCU CCUGG CAAGUAAUC AGGAUAGGCU \ CCGG GGACU GUUCAUUAG UCUUAUCCGG G ACCAUAGUUACACUGUUCC^ CGGA UU U CAUGACG . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Aca-Mir-26-P4_5p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UUCAAGUAAUCCAGGAUAGGCU -22
Get sequence
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Star sequence | Aca-Mir-26-P4_3p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
39- CCUAUUCUUGAUUACUUGUUUC -61
Get sequence
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