MirGeneDB ID | Oan-Mir-26-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Family name | MIR-26 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Platypus (Ornithorhynchus anatinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | oan-mir-26-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Oan-Mir-26-P1 Oan-Mir-26-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aca-Mir-26-P4 Ami-Mir-26-P4 Bta-Mir-26-P4 Cfa-Mir-26-P4 Cja-Mir-26-P4 Cpi-Mir-26-P4 Cpo-Mir-26-P4 Dno-Mir-26-P4 Dre-Mir-26-P4 Eca-Mir-26-P4 Ete-Mir-26-P4 Gga-Mir-26-P4 Gja-Mir-26-P4 Gmo-Mir-26-P4 Hsa-Mir-26-P4 Laf-Mir-26-P4 Lch-Mir-26-P4 Loc-Mir-26-P4 Mal-Mir-26-P4 Mdo-Mir-26-P4 Mml-Mir-26-P4 Mmr-Mir-26-P4 Mmu-Mir-26-P4 Mun-Mir-26-P4 Neu-Mir-26-P4 Ocu-Mir-26-P4 Pab-Mir-26-P4 Pbv-Mir-26-P4 Pma-Mir-26-o4 Rno-Mir-26-P4 Sha-Mir-26-P4 Spt-Mir-26-P4 Sto-Mir-26-P4 Tgu-Mir-26-P4 Tni-Mir-26-P4 Xla-Mir-26-P4a Xla-Mir-26-P4b Xtr-Mir-26-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (mOrnAna1.p.v1_plustraces) |
NC_041737.1: 59432068-59432124 [-] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UCAAGUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GGUCCGGACAGUCUCGGGGCUCCCGCCCGGUUCAAGUAAUCCAGGAUAGGCUGUCGGCACCACGGCCUGUCCUCGGUUACUUGUCUCGGGAGGUGGCCGCCCACACCCCAACGCCCGGet precursor sequence |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 GGUCCGGACAGUCUCGG--| UC G UU C GUCGG GGC CC CCCGG CAAGUAAUC AGGAUAGGCU \ CCG GG GGGCU GUUCAUUGG UCCUGUCCGG C GCCCGCAACCCCACACCCG^ GU A CU C CACCA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mature sequence | Oan-Mir-26-P4_5p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | MIMAT0006991 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UUCAAGUAAUCCAGGAUAGGCU -22
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Star sequence | Oan-Mir-26-P4_3p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | MIMAT0006992 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- CCUGUCCUCGGUUACUUGUCUC -57
Get sequence
|