Mir
Gene
DB
2.1
Home
Browse
Search
Download
Information
69 microRNA genes with seed ACAGUAC
Sort by genome coordinates
Motifs
MirGeneDB ID
MiRBase ID
Family
Seed
5p accession
3p accession
Chromosome
Start
End
Strand
Node of origin (locus)
▲
Node of origin (family)
3' NTU
UG
UGUG
CNNC
Lch-Mir-101-P1
None
MIR-101
ACAGUAC
None
None
JH130703.1
86604
86662
-
Vertebrata
Vertebrata
Unknown
1
Spt-Mir-101-P2
None
MIR-101
ACAGUAC
None
None
QEPC01011191.1
4589436
4589494
-
Vertebrata
Vertebrata
Unknown
1
Lch-Mir-101-P2
None
MIR-101
ACAGUAC
None
None
JH129674.1
173917
173975
+
Vertebrata
Vertebrata
Unknown
1
1
Tgu-Mir-101-P1-v1
tgu-mir-101-2
MIR-101
ACAGUAC
MIMAT0014631
MIMAT0014508
8
1553620
1553678
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
1
Sto-Mir-101-P1-v1
None
MIR-101
ACAGUAC
None
None
BFAA01000061.1
1365251
1365309
-
Vertebrata
Vertebrata
No
1
1
Hsa-Mir-101-P1-v1
hsa-mir-101-1
MIR-101
ACAGUAC
MIMAT0004513
MIMAT0000099
chr1
65058441
65058499
-
Vertebrata
Vertebrata
No
1
1
Ami-Mir-101-P1-v1
ami-mir-101-1
MIR-101
ACAGUAC
MIMAT0038116
MIMAT0038117
NW_017710321.1
12121219
12121277
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
1
Cmi-Mir-101-P1-v1
None
MIR-101
ACAGUAC
None
None
KI635887.1
6427947
6428005
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
1
Mml-Mir-101-P1-v1
mml-mir-101-1
MIR-101
ACAGUAC
MIMAT0026581
MIMAT0002431
chr1
64744976
64745034
-
Vertebrata
Vertebrata
No
1
1
Cpi-Mir-101-P1-v1
cpi-mir-101-1
MIR-101
ACAGUAC
MIMAT0037716
MIMAT0037717
JH584706
839802
839860
-
Vertebrata
Vertebrata
No
1
1
Mmu-Mir-101-P1-v1
mmu-mir-101a
MIR-101
ACAGUAC
MIMAT0004526
MIMAT0000133
chr4
101346956
101347014
-
Vertebrata
Vertebrata
No
1
1
Aca-Mir-101-P1-v1
aca-mir-101-1
MIR-101
ACAGUAC
MIMAT0021710
MIMAT0021711
4
98411454
98411512
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
1
Rno-Mir-101-P1-v1
rno-mir-101a
MIR-101
ACAGUAC
MIMAT0004726
MIMAT0000823
chr5
120168444
120168502
-
Vertebrata
Vertebrata
No
1
1
Pbv-Mir-101-P1-v1
pbv-mir-101-1
MIR-101
ACAGUAC
MIMAT0038901
MIMAT0038902
KE954279.1
114044
114102
-
Vertebrata
Vertebrata
No
1
1
Cpo-Mir-101-P1-v1
cpo-mir-101-1
MIR-101
ACAGUAC
MIMAT0046947
MIMAT0046948
scaffold_2
67531172
67531230
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
1
Gja-Mir-101-P1-v1
None
MIR-101
ACAGUAC
None
None
NW_015177048.1
96034
96092
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
1
Ocu-Mir-101-P1-v1
ocu-mir-101-1
MIR-101
ACAGUAC
MIMAT0048186
MIMAT0048187
chr13
101340538
101340596
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
1
Cfa-Mir-101-P1-v1
cfa-mir-101-1
MIR-101
ACAGUAC
None
MIMAT0006600
chr5
45184772
45184830
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
1
Bta-Mir-101-P1-v1
bta-mir-101-1
MIR-101
ACAGUAC
None
MIMAT0003520
NC_037330.1
80335449
80335507
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
1
Xtr-Mir-101-P1-v1
xtr-mir-101a-2
MIR-101
ACAGUAC
None
MIMAT0003662
chr4
79102563
79102621
-
Vertebrata
Vertebrata
No
1
1
Dno-Mir-101-P1-v1
dno-mir-101-1
MIR-101
ACAGUAC
MIMAT0047598
MIMAT0047599
JH582969
1484135
1484193
-
Vertebrata
Vertebrata
No
1
1
Mun-Mir-101-P1-v1
None
MIR-101
ACAGUAC
None
None
101-P1-v1_LR594637.1:42114281-42114423
43
101
-
Vertebrata
Vertebrata
No
1
1
Ete-Mir-101-P1-v1
None
MIR-101
ACAGUAC
None
None
JH980298
60204639
60204697
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
1
Sha-Mir-101-P1-v1
sha-mir-101
MIR-101
ACAGUAC
None
MIMAT0022811
GL856736.1
1265481
1265539
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
1
Tni-Mir-101-P1-v1
tni-mir-101a
MIR-101
ACAGUAC
None
MIMAT0002903
1
20355621
20355679
+
Vertebrata
Vertebrata
No
Mdo-Mir-101-P1-v1
mdo-mir-101-1
MIR-101
ACAGUAC
MIMAT0031076
MIMAT0004098
2
26267875
26267933
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
1
Gmo-Mir-101-P1-v1
gmo-mir-101a
MIR-101
ACAGUAC
MIMAT0044119
MIMAT0044120
GeneScaffold_1472
99849
99907
-
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Oan-Mir-101-P1-v1
oan-mir-101-1
MIR-101
ACAGUAC
None
MIMAT0007011
NC_041745.1
41083106
41083164
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
1
Mal-Mir-101-P1-v1
None
MIR-101
ACAGUAC
None
None
KV884746.1
1742489
1742547
-
Vertebrata
Vertebrata
No
Gga-Mir-101-P1-v1
gga-mir-101-2
MIR-101
ACAGUAC
MIMAT0031077
MIMAT0001185
8
28612656
28612714
-
Vertebrata
Vertebrata
No
1
1
Dre-Mir-101-P1-v1
dre-mir-101a
MIR-101
ACAGUAC
None
MIMAT0001814
chr6
31365458
31365516
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
1
Cli-Mir-101-P1-v1
cli-mir-101-1
MIR-101
ACAGUAC
MIMAT0038482
MIMAT0038483
scaffold7
15720708
15720766
-
Vertebrata
Vertebrata
No
1
1
Loc-Mir-101-P1-v1
None
MIR-101
ACAGUAC
None
None
LG10
10266778
10266836
-
Vertebrata
Vertebrata
No
1
1
Tgu-Mir-101-P2-v1
tgu-mir-101-1
MIR-101
ACAGUAC
MIMAT0031101
MIMAT0014508
Z
68899072
68899130
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Sto-Mir-101-P2-v1
None
MIR-101
ACAGUAC
None
None
BFAA01004869.1
93866
93924
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Hsa-Mir-101-P2-v1
hsa-mir-101-2
MIR-101
ACAGUAC
MIMAT0037312
MIMAT0000099
chr9
4850308
4850366
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Ami-Mir-101-P2-v1
ami-mir-101-2
MIR-101
ACAGUAC
MIMAT0038118
MIMAT0038117
NW_017713772.1
32263711
32263769
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Cmi-Mir-101-P2-v1
None
MIR-101
ACAGUAC
None
None
KI635975.1
375730
375787
-
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Mml-Mir-101-P2-v1
mml-mir-101-2
MIR-101
ACAGUAC
MIMAT0031100
MIMAT0002431
chr15
79649347
79649405
-
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Cpi-Mir-101-P2-v1
cpi-mir-101-2
MIR-101
ACAGUAC
MIMAT0037718
MIMAT0037717
JH584680
13719006
13719064
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Mmu-Mir-101-P2-v1
mmu-mir-101b
MIR-101
ACAGUAC
MIMAT0017046
MIMAT0000616
chr19
29135302
29135360
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Aca-Mir-101-P2-v1
aca-mir-101-2
MIR-101
ACAGUAC
MIMAT0021712
MIMAT0021711
2
52137657
52137715
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Rno-Mir-101-P2-v1
rno-mir-101b
MIR-101
ACAGUAC
MIMAT0017045
MIMAT0000615
chr1
247263746
247263804
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Pbv-Mir-101-P2-v1
pbv-mir-101-2
MIR-101
ACAGUAC
MIMAT0038903
MIMAT0038902
KE954797.1
126581
126639
-
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Cpo-Mir-101-P2-v1
cpo-mir-101-2
MIR-101
ACAGUAC
MIMAT0046949
MIMAT0046948
scaffold_21
15000495
15000553
-
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Gja-Mir-101-P2-v1
None
MIR-101
ACAGUAC
None
None
NW_015163623.1
608902
608960
-
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Ocu-Mir-101-P2-v1
ocu-mir-101-2
MIR-101
ACAGUAC
MIMAT0048188
MIMAT0048187
chr1
49384671
49384729
-
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Cfa-Mir-101-P2-v1
cfa-mir-101-2
MIR-101
ACAGUAC
None
MIMAT0006600
chr1
93194326
93194384
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Bta-Mir-101-P2-v1
bta-mir-101-2
MIR-101
ACAGUAC
None
MIMAT0003520
NC_037335.1
39689038
39689096
-
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Xtr-Mir-101-P2-v1
xtr-mir-101a-1
MIR-101
ACAGUAC
None
MIMAT0003662
chr1
115031351
115031409
-
Vertebrata
Vertebrata
No
1
1
Dno-Mir-101-P2-v1
dno-mir-101-2
MIR-101
ACAGUAC
MIMAT0047600
MIMAT0047599
JH567481
2307391
2307449
-
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Mun-Mir-101-P2-v1
None
MIR-101
ACAGUAC
None
None
101-P2-v1_LR594633.1:234314504-234314646
43
101
-
Vertebrata
Vertebrata
No
1
1
Ete-Mir-101-P2-v1
None
MIR-101
ACAGUAC
None
None
JH980382
6713736
6713794
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Sha-Mir-101-P2-v1
None
MIR-101
ACAGUAC
None
None
GL841562.1
1424390
1424448
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Tni-Mir-101-P2-v1
tni-mir-101b
MIR-101
ACAGUAC
None
MIMAT0003040
4
1028860
1028918
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
1
Mdo-Mir-101-P2-v1
mdo-mir-101-2
MIR-101
ACAGUAC
MIMAT0026657
MIMAT0004098
6
166669177
166669235
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Gmo-Mir-101-P2-v1
gmo-mir-101b
MIR-101
ACAGUAC
MIMAT0044231
MIMAT0044232
GeneScaffold_3576
29659
29717
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
1
Oan-Mir-101-P2-v1
oan-mir-101-2
MIR-101
ACAGUAC
None
MIMAT0007011
NC_041753.1
52495166
52495224
-
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Mal-Mir-101-P2-v1
None
MIR-101
ACAGUAC
None
None
KV884763.1
1469811
1469869
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
1
Gga-Mir-101-P2-v1
gga-mir-101-1
MIR-101
ACAGUAC
MIMAT0026545
MIMAT0001185
Z
27510598
27510656
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Dre-Mir-101-P2-v1
dre-mir-101b
MIR-101
ACAGUAC
None
MIMAT0001815
chr5
1837176
1837234
-
Vertebrata
Vertebrata
No
1
1
1
Cli-Mir-101-P2-v1
cli-mir-101-2
MIR-101
ACAGUAC
MIMAT0038484
MIMAT0038483
scaffold6
3523034
3523092
-
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Loc-Mir-101-P2-v1
None
MIR-101
ACAGUAC
None
None
LG2
37364265
37364323
-
Vertebrata
Vertebrata
No
1
1
Xla-Mir-101-P1a-v1
None
MIR-101
ACAGUAC
None
None
NC_030730.1
73858577
73858635
+
X. laevis
Vertebrata
No
1
1
Xla-Mir-101-P2a-v1
xla-mir-101
MIR-101
ACAGUAC
MIMAT0046412
MIMAT0046413
NC_030724.1
125355859
125355917
-
X. laevis
Vertebrata
No
1
Xla-Mir-101-P1b-v1
None
MIR-101
ACAGUAC
None
None
NC_030731.1
58882293
58882351
+
X. laevis
Vertebrata
No
1
1
Xla-Mir-101-P2b-v1
None
MIR-101
ACAGUAC
None
None
NW_016694889.1
314986
315044
-
X. laevis
Vertebrata
No
1
1
Spt-Mir-101-P1d
None
MIR-101
ACAGUAC
None
None
QEPC01013865.1
24500970
24501028
-
S. punctatus
Vertebrata
Unknown
1
1
Spt-Mir-101-P1c
None
MIR-101
ACAGUAC
None
None
QEPC01013865.1
24503586
24503644
-
S. punctatus
Vertebrata
Unknown
1
1
Download sequences for:
precursor
|
5p
|
3p
|
mature
|
star
|
mature/star
|
loop
|
extend_pre
|
all