MirGeneDB ID | Mml-Mir-337-as | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Family name | MIR-337 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Mml-Mir-337-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cja-Mir-337 Eca-Mir-337 Eca-Mir-337-as Hsa-Mir-337-as Laf-Mir-337 Mmu-Mir-337 Mmu-Mir-337-as Ocu-Mir-337-as Pab-Mir-337 Rno-Mir-337 Rno-Mir-337-as | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Euarchontoglires | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_003339765.3_Mmul_10_traces) |
CM014342.1: 163094789-163094848 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-337-as) |
Mir-770
CM014342.1: 163071875-163071936 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-493 CM014342.1: 163089342-163089403 [+] UCSC Ensembl Mir-337-as CM014342.1: 163094789-163094848 [-] UCSC Ensembl Mir-337-v1 CM014342.1: 163094791-163094850 [+] UCSC Ensembl Mir-337-v2 CM014342.1: 163094791-163094850 [+] UCSC Ensembl Mir-431 CM014342.1: 163101602-163101665 [+] UCSC Ensembl Mir-433 CM014342.1: 163102473-163102546 [+] UCSC Ensembl Mir-127 CM014342.1: 163103577-163103632 [+] UCSC Ensembl Mir-432 CM014342.1: 163105075-163105143 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v2 CM014342.1: 163105295-163105350 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v1 CM014342.1: 163105295-163105350 [+] UCSC Ensembl Mir-370 CM014342.1: 163131698-163131754 [+] UCSC Ensembl |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GAAAGGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCGGGGGCUGCGCGUGGUUGAAGGGGAUGAAGAAAGGCAUCAUAUAGGAGCUGGAUAACUGUGCAUCAACUCCUGUAUGAAGCCGUUCCCACCCCCCAACUACUGACUACGGGCCGCAACGet precursor sequence |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CCGGGGGCUGCGCGUGGUUGAA--| A AA A A C GAUAAC GGGG UG GAA GGC UCAUAUAGGAG UG \ CCCC AC CUU CCG AGUAUGUCCUC AC U CAACGCCGGGCAUCAGUCAUCAAC^ C C- G A A UACGUG . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mature sequence | Mml-Mir-337-as_5p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGAAAGGCAUCAUAUAGGAGCUG -23
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Co-mature sequence | Mml-Mir-337-as_3p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- ACUCCUGUAUGAAGCCGUUCCC -60
Get sequence
|