MirGeneDB ID | Mml-Mir-431 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-431 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GUCUUGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mml-mir-431 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-431 Cfa-Mir-431 Cpo-Mir-431 Ete-Mir-431 Hsa-Mir-431 Mmu-Mir-431 Ocu-Mir-431 Rno-Mir-431 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (rheMac8_trace) |
chr7: 163215224-163215287 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-431) |
Mir-770
chr7: 163185011-163185072 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-493 chr7: 163202852-163202913 [+] UCSC Ensembl Mir-337-v1 chr7: 163207997-163208056 [+] UCSC Ensembl Mir-337-v2 chr7: 163207997-163208056 [+] UCSC Ensembl Mir-431 chr7: 163215224-163215287 [+] UCSC Ensembl Mir-433 chr7: 163216095-163216168 [+] UCSC Ensembl Mir-127 chr7: 163217199-163217254 [+] UCSC Ensembl Mir-432 chr7: 163218697-163218765 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v2 chr7: 163218917-163218972 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v1 chr7: 163218917-163218972 [+] UCSC Ensembl Mir-370 chr7: 163245322-163245378 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GCACGUCGUUGUCCUGCUUGUCCUGCGAGGUGUCUUGCAGGCCGUCAUGCAGGCCACACUGACGGUAACGUUGCAGGUCGUCUUGCAGGGCUUCUCGCAAGACGACAUCCUCAUCACCAACGACGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 GCACGUCGUUGUCCUGC--| C U C UCA GGCCACACU UUGUC UGCGAGG GUCUUGCAGG CG UGCA G AGCAG ACGCUCU CGGGACGUUC GC ACGU A CAGCAACCACUACUCCUAC^ A U U UGG UGCAAUGGC 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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Comment | There are Dicer cuts +2 and +3. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Mml-Mir-431_5p |
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mirBase accession | MIMAT0006326 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UGUCUUGCAGGCCGUCAUGCA -21
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-431 |
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Co-mature sequence | Mml-Mir-431_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
43- CAGGUCGUCUUGCAGGGCUUC -64
Get sequence
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