| MirGeneDB ID | Mml-Mir-433 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Family name | MIR-433 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mml-mir-433 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-433 Cfa-Mir-433 Cja-Mir-433 Cpo-Mir-433 Dno-Mir-433 Eca-Mir-433 Ete-Mir-433 Hsa-Mir-433 Laf-Mir-433 Mmr-Mir-433 Mmu-Mir-433 Ocu-Mir-433 Pab-Mir-433 Rno-Mir-433 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_003339765.3_Mmul_10_traces) |
CM014342.1: 163102473-163102546 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-433) |
Mir-770
CM014342.1: 163071875-163071936 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-493 CM014342.1: 163089342-163089403 [+] UCSC Ensembl Mir-337-as CM014342.1: 163094789-163094848 [-] UCSC Ensembl Mir-337-v1 CM014342.1: 163094791-163094850 [+] UCSC Ensembl Mir-337-v2 CM014342.1: 163094791-163094850 [+] UCSC Ensembl Mir-431 CM014342.1: 163101602-163101665 [+] UCSC Ensembl Mir-433 CM014342.1: 163102473-163102546 [+] UCSC Ensembl Mir-127 CM014342.1: 163103577-163103632 [+] UCSC Ensembl Mir-432 CM014342.1: 163105075-163105143 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v2 CM014342.1: 163105295-163105350 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v1 CM014342.1: 163105295-163105350 [+] UCSC Ensembl Mir-370 CM014342.1: 163131698-163131754 [+] UCSC Ensembl |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UCAUGAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GAAGAAGAAGACCCAAUGCCCAGGGAGAAGUACGGUGAGCCUGUCAUUAUUCAGAGAGGCUAGAUCCUCUGUGUUGAGAAGGAUCAUGAUGGGCUCCUCGGUGUUCUCCAGGUAGCGGCACCACACCAUGAAGGGet precursor sequence |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 GAAGAAGAAGACCCAAU- --| AG GUA U U AGAGAGGCUAGAU GC CC GGAGAA CGG GAGCCUGUCAU AUUC C CG GG CCUCUU GCU CUCGGGUAGUA UAGG C GGAAGUACCACACCACGG AU^ A- GUG C C AAGAGUUGUGUCU 130 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Star sequence | Mml-Mir-433_5p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | MIMAT0026875 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UACGGUGAGCCUGUCAUUAUUC -22
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-433-5p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mature sequence | Mml-Mir-433_3p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | MIMAT0006328 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
52- AUCAUGAUGGGCUCCUCGGUGU -74
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-433-3p |
