| MirGeneDB ID | Dno-Mir-433 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-433 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | ACGGUGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dno-mir-433 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-433 Cfa-Mir-433 Cpo-Mir-433 Ete-Mir-433 Hsa-Mir-433 Mml-Mir-433 Mmu-Mir-433 Ocu-Mir-433 Rno-Mir-433 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (dasNov3) |
JH578221: 4095-4168 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-433) |
Mir-433
JH578221: 4095-4168 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-127 JH578221: 5211-5266 [+] UCSC Ensembl Mir-432 JH578221: 6661-6729 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v1 JH578221: 6860-6915 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v2 JH578221: 6860-6915 [+] UCSC Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GAAGAAGCCGAGCCAGCGGCCGGGGAGAAGUACGGUGAGCCUGUCAUUAUUCAGAGAGGCAUGAUCCUCAUCUUUGAGAAGAAUCAUGAUGGGCUCCUCGGUGUUCUCCAGGUAGCGGCGCCACACCAUGAAGGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 GAAGAAGCCGAGCCAGCG---| GG GUA U U AGAGAGGCAUGAU GCC GGAGAA CGG GAGCCUGUCAU AUUC C UGG CCUCUU GCU CUCGGGUAGUA UAAG C GGAAGUACCACACCGCGGCGA^ A- GUG C C AAGAGUUUCUACU 130 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dno-Mir-433_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0047890 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UACGGUGAGCCUGUCAUUAUUC -22
Get sequence
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| Co-mature sequence | Dno-Mir-433_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0047891 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
52- AUCAUGAUGGGCUCCUCGGUGU -74
Get sequence
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