| MirGeneDB ID | Dno-Mir-136 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-136 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dno-mir-136 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-136-v1 Cfa-Mir-136-v1 Cja-Mir-136 Cpo-Mir-136-v1 Eca-Mir-136-v1 Ete-Mir-136-v1 Hsa-Mir-136-v1 Laf-Mir-136 Mml-Mir-136-v1 Mmr-Mir-136-v1 Mmu-Mir-136-v1 Ocu-Mir-136-v1 Pab-Mir-136 Rno-Mir-136-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (dasNov3) |
JH578221: 6860-6915 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-136-v1) |
Mir-433
JH578221: 4095-4168 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-127 JH578221: 5211-5266 [+] UCSC Ensembl Mir-432 JH578221: 6661-6729 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v1 JH578221: 6860-6915 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v2 JH578221: 6860-6915 [+] UCSC Ensembl |
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| Variant | Dno-Mir-136-v1 |
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| Seed | AUCAUCG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCGCGGCGGCGUCGGAUGAGCCCUCGGAGGACUCCAUUUGUUUUGAUGAUGGAUUCCUACGCUCCAUCAUCGUCUCAAAUGAGUCUUCAGAGGGUUCCAUCAUGUCUUCGGAUGGCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CCGCGGCGGCGUCGGAU--| G C UUU UUCC GAGCCCUC GAGGACUC AUUUG UGAUGAUGGA \ CUUGGGAG CUUCUGAG UAAAC GCUACUACCU U CGGUAGGCUUCUGUACUAC^ A - UCU CGCA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dno-Mir-136-v1_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0047644 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACUCCAUUUGUUUUGAUGAUGGA -23
Get sequence
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| Mature sequence | Dno-Mir-136-v1_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0047645 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
34- CAUCAUCGUCUCAAAUGAGUCU -56
Get sequence
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| Variant | Dno-Mir-136-v2 |
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| Seed | UCAUCGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCGCGGCGGCGUCGGAUGAGCCCUCGGAGGACUCCAUUUGUUUUGAUGAUGGAUUCCUACGCUCCAUCAUCGUCUCAAAUGAGUCUUCAGAGGGUUCCAUCAUGUCUUCGGAUGGCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CCGCGGCGGCGUCGGAU--| G C UUU AUUCC GAGCCCUC GAGGACUC AUUUG UGAUGAUGG \ CUUGGGAG CUUCUGAG UAAAC GCUACUACC U CGGUAGGCUUCUGUACUAC^ A - UCU UCGCA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dno-Mir-136-v2_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0047644 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACUCCAUUUGUUUUGAUGAUGG -22
Get sequence
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| Mature sequence | Dno-Mir-136-v2_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0047645 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- AUCAUCGUCUCAAAUGAGUCU -56
Get sequence
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