| MirGeneDB ID | Mml-Mir-337 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-337 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mml-mir-337 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mml-Mir-337-as Mml-Mir-337-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cja-Mir-337 Eca-Mir-337 Laf-Mir-337 Mmu-Mir-337 Pab-Mir-337 Rno-Mir-337 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_003339765.3_Mmul_10_traces) |
CM014342.1: 163094791-163094850 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-337-v2) |
Mir-770
CM014342.1: 163071875-163071936 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-493 CM014342.1: 163089342-163089403 [+] UCSC Ensembl Mir-337-as CM014342.1: 163094789-163094848 [-] UCSC Ensembl Mir-337-v1 CM014342.1: 163094791-163094850 [+] UCSC Ensembl Mir-337-v2 CM014342.1: 163094791-163094850 [+] UCSC Ensembl Mir-431 CM014342.1: 163101602-163101665 [+] UCSC Ensembl Mir-433 CM014342.1: 163102473-163102546 [+] UCSC Ensembl Mir-127 CM014342.1: 163103577-163103632 [+] UCSC Ensembl Mir-432 CM014342.1: 163105075-163105143 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v2 CM014342.1: 163105295-163105350 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v1 CM014342.1: 163105295-163105350 [+] UCSC Ensembl Mir-370 CM014342.1: 163131698-163131754 [+] UCSC Ensembl |
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| Variant | Mml-Mir-337-v2 |
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| Seed | UCCUAUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGCGGCCCGUAGUCAGUAGUUGGGGGGUGGGAACGGCUUCAUACAGGAGUUGAUGCACAGUUAUCCAGCUCCUAUAUGAUGCCUUUCUUCAUCCCCUUCAACCACGCGCAGCCCCCGGACGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UGCGGCCCGUAGUCAGUA -- -| C U C GAUGCAC GUUG GGGGGUG GGAA GGC UCAUA AGGAGUU \ CAAC CCCCUAC UCUU CCG AGUAU UCCUCGA A CAGGCCCCCGACGCGCAC UU U^ U U A CCUAUUG . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mml-Mir-337-v2_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0006275 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GAACGGCUUCAUACAGGAGUU -21
Get sequence
|
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-337-5p |
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| Mature sequence | Mml-Mir-337-v2_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0006276 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- CUCCUAUAUGAUGCCUUUCUUC -60
Get sequence
|
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-337-3p |
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| Variant | Mml-Mir-337-v1 |
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| Seed | CCUAUAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGCGGCCCGUAGUCAGUAGUUGGGGGGUGGGAACGGCUUCAUACAGGAGUUGAUGCACAGUUAUCCAGCUCCUAUAUGAUGCCUUUCUUCAUCCCCUUCAACCACGCGCAGCCCCCGGACGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UGCGGCCCGUAGUCAGUA -- -| C U C UGAUGCAC GUUG GGGGGUG GGAA GGC UCAUA AGGAGU \ CAAC CCCCUAC UCUU CCG AGUAU UCCUCG A CAGGCCCCCGACGCGCAC UU U^ U U A ACCUAUUG . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mml-Mir-337-v1_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0006275 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GAACGGCUUCAUACAGGAGU -20
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-337-5p |
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| Mature sequence | Mml-Mir-337-v1_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0006276 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- UCCUAUAUGAUGCCUUUCUUC -60
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-337-3p |
