| MirGeneDB ID | Ofu-Mir-1986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1986 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Tubeworm (Owenia fusiformis) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Agr-Mir-1986 Cte-Mir-1986 Eba-Mir-1986 Efe-Mir-1986 Hru-Mir-1986-P1 Hru-Mir-1986-P2 Lan-Mir-1986 Lgi-Mir-1986 Lhy-Mir-1986 Mgi-Mir-1986 Mom-Mir-1986 Npo-Mir-1986 Obi-Mir-1986 Ovu-Mir-1986 Pdu-Mir-1986 Pve-Mir-1986-P3 Pve-Mir-1986-P4 Pve-Mir-1986-P5 Rph-Mir-1986 War-Mir-1986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Lophotrochozoa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Lophotrochozoa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_903813345.2_Owenia) |
CAIIXF020000006.1: 29788995-29789048 [-] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-1986) |
Mir-1986
CAIIXF020000006.1: 29788995-29789048 [-]
Mir-1990-P2 CAIIXF020000006.1: 29791317-29791373 [-] Mir-2692 CAIIXF020000006.1: 29791862-29791922 [-] Mir-1990-P1 CAIIXF020000006.1: 29792074-29792131 [-] |
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| Seed | CAGGGUC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GUAGUGGUGAAAAAAUUGGCAACGUACAGUCCAGGGUCCUGGGGAGGCCACGUGAAUAACUGUGGAUUUCCCAUGAUCCGUAACUGUAUGCUGCUUGAAUCUACUGGUGCAUGGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GUAGUGGUGAAAAAAUU--| A CCA C G UGA GGCA CGUACAGU GGGUC UGGGGAG CCACG A UCGU GUAUGUCA CCUAG ACCCUUU GGUGU U GGUACGUGGUCAUCUAAGU^ C AUG U A CAA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Ofu-Mir-1986_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CCAGGGUCCUGGGGAGGCCACG -22
Get sequence
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| Star sequence | Ofu-Mir-1986_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
32- UGGAUUUCCCAUGAUCCGUAAC -54
Get sequence
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