| MirGeneDB ID | Ofu-Mir-2692 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-2692 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Tubeworm (Owenia fusiformis) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cte-Mir-2692 Pdu-Mir-2692 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Annelida | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Annelida | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_903813345.2_Owenia) |
CAIIXF020000006.1: 29791862-29791922 [-] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-2692) |
Mir-1986
CAIIXF020000006.1: 29788995-29789048 [-]
Mir-1990-P2 CAIIXF020000006.1: 29791317-29791373 [-] Mir-2692 CAIIXF020000006.1: 29791862-29791922 [-] Mir-1990-P1 CAIIXF020000006.1: 29792074-29792131 [-] |
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| Seed | CAGUCAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AGCAAAGGGAAAUGGAUGAAGUUAGCUAGUGUUGGUGUCAAAUUGACAGAGUGUACAUUUUAUAUUCACCAGUCAAUUUUGACACCACCGCUUGAAAACUUUAACGAUCUACAGACUCCGGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 AGCAAAGGGAAAUGGAU-- AGCU U -| AGA UACAUU GAAGUU AGUG UGGUGUC AAAUUGAC GUG \ UUUCAA UCGC ACCACAG UUUAACUG CAC U GGCCUCAGACAUCUAGCAA AAGU C U^ AC- UUAUAU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Ofu-Mir-2692_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GUUGGUGUCAAAUUGACAGAGUG -23
Get sequence
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| Mature sequence | Ofu-Mir-2692_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- CCAGUCAAUUUUGACACCACCGC -61
Get sequence
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