| MirGeneDB ID | Efe-Mir-1986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1986 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Common brandling worm (Eisenia fetida) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Agr-Mir-1986 Cte-Mir-1986 Eba-Mir-1986 Hru-Mir-1986-P1 Hru-Mir-1986-P2 Lan-Mir-1986 Lgi-Mir-1986 Lhy-Mir-1986 Mgi-Mir-1986 Mom-Mir-1986 Npo-Mir-1986 Obi-Mir-1986 Ofu-Mir-1986 Ovu-Mir-1986 Pdu-Mir-1986 Pve-Mir-1986-P3 Pve-Mir-1986-P4 Pve-Mir-1986-P5 Rph-Mir-1986 War-Mir-1986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Lophotrochozoa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Lophotrochozoa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Efe_combined) |
Efet.01.639074: 392-453 [+] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GGAUUUC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GUCGUCACAGAGAGAGUGGAAGAUGGCGGUUAGGGAUUUUGAGGAAACCGCACGUCCAUCUAACCAGUUGUGGAUUUCUCAUGAUCCUUAAUCGCUUCUUCCACACAUCGAGUUCAAGCGAAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 GUCGUCACAGAGAGAGU---| U U A CGUCCAU GGAAGA GGCGGUUAGGGAUU UGAGGAA CCGCA C CCUUCU UCGCUAAUUCCUAG ACUCUUU GGUGU U AAGCGAACUUGAGCUACACA^ - U A UGACCAA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Efe-Mir-1986_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UAGGGAUUUUGAGGAAACCGCA -22
Get sequence
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| Mature sequence | Efe-Mir-1986_3p (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- UGGAUUUCUCAUGAUCCUUAAU -62
Get sequence
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