MirGeneDB ID | Mun-Mir-375-P7b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-375 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UUGUUCG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Microcaecilia (Microcaecilia unicolor) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Mun-Mir-375-P7a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-375 Aca-Mir-375 Ami-Mir-375 Asu-Mir-375 Bfl-Mir-375 Bge-Mir-375 Bla-Mir-375 Bpl-Mir-375 Bta-Mir-375 Cbr-Mir-375 Cel-Mir-375 Cfa-Mir-375 Cin-Mir-375 Cli-Mir-375 Cpi-Mir-375 Cpo-Mir-375 Cte-Mir-375 Dan-Mir-375 Dma-Mir-375 Dme-Mir-375 Dmo-Mir-375 Dno-Mir-375 Dpu-Mir-375 Dsi-Mir-375 Dya-Mir-375 Ebu-Mir-375 Efe-Mir-375 Esc-Mir-375 Ete-Mir-375 Gga-Mir-375 Gja-Mir-375 Hme-Mir-375 Hsa-Mir-375 Isc-Mir-375 Lan-Mir-375 Lch-Mir-375 Lgi-Mir-375 Loc-Mir-375 Mdo-Mir-375 Mml-Mir-375 Mmu-Mir-375 Npo-Mir-375 Oan-Mir-375 Obi-Mir-375 Ocu-Mir-375 Ovu-Mir-375 Pbv-Mir-375 Pfl-Mir-375 Pmi-Mir-375 Rno-Mir-375 Sha-Mir-375 Sko-Mir-375 Spt-Mir-375 Spu-Mir-375 Sto-Mir-375 Tca-Mir-375 Tgu-Mir-375 Xtr-Mir-375 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | M. unicolor | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Mun_miRNA_loci) |
375_CABFKK010000927.1:144705-144847: 43-101 [-] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CCAGACCCGGACCAACUCUGCGCUUGCCUCACGCCGAGCCAGACGCGCAAUGCCUUAAAGUCAGCGUUUUGUUCGUUCGGCUCGCGUUAAGCAGGCUCAGCAUGGCAGCCAGCGCCGGCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CCAGACCCGGACCAACU--| C CUC C AG C U CUUAA CUG GCUUGC ACGC GAGCC ACG GCAA GC A GAC CGGACG UGCG CUCGG UGC UGUU UG G CGGCCGCGACCGACGGUAC^ U AAU - CU U U CGACU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mun-Mir-375-P7b_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- ACGCCGAGCCAGACGCGCAAUGC -23
Get sequence
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Mature sequence | Mun-Mir-375-P7b_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- UUUGUUCGUUCGGCUCGCGUUA -59
Get sequence
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