| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-26-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-26 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-26a-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mmu-Mir-26-P2 Mmu-Mir-26-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aca-Mir-26-P1 Ami-Mir-26-P1 Bta-Mir-26-P1 Cfa-Mir-26-P1 Cja-Mir-26-P1 Cli-Mir-26-P1 Cmi-Mir-26-P1 Cpi-Mir-26-P1 Cpo-Mir-26-P1 Dno-Mir-26-P1 Dre-Mir-26-P1a Dre-Mir-26-P1b Eca-Mir-26-P1 Ete-Mir-26-P1 Gga-Mir-26-P1 Gja-Mir-26-P1 Gmo-Mir-26-P1a Gmo-Mir-26-P1b Hsa-Mir-26-P1 Laf-Mir-26-P1 Lch-Mir-26-P1 Loc-Mir-26-P1 Mal-Mir-26-P1a Mal-Mir-26-P1b Mdo-Mir-26-P1 Mml-Mir-26-P1 Mmr-Mir-26-P1 Mun-Mir-26-P1 Neu-Mir-26-P1 Oan-Mir-26-P1 Ocu-Mir-26-P1 Pab-Mir-26-P1 Pbv-Mir-26-P1 Pma-Mir-26-o1 Rno-Mir-26-P1 Sha-Mir-26-P1 Spt-Mir-26-P1 Sto-Mir-26-P1 Tgu-Mir-26-P1 Tni-Mir-26-P1a Tni-Mir-26-P1b Xla-Mir-26-P1c Xla-Mir-26-P1d Xtr-Mir-26-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr9: 119031811-119031871 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UCAAGUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
ACCGAGGCCCUGGCGAAGGCCGUGGCCUCGUUCAAGUAAUCCAGGAUAGGCUGUGCAGGUCCCAAGGGGCCUAUUCUUGGUUACUUGCACGGGGACGCGGGCCUGGACGCCGGCAUCUGGGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 ACCGAGGCCCUGGCGAA- -| G U C GUGCAGG GG CCGUG CCUCGU CAAGUAAUC AGGAUAGGCU \ CC GGCGC GGGGCA GUUCAUUGG UCUUAUCCGG U GGGUCUACGGCCGCAGGU G^ A C U GGAACCC . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-26-P1_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0000533 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUCAAGUAAUCCAGGAUAGGCU -22
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000533 TargetScanVert: mmu-miR-26a-5p miRDB: MIMAT0000533 |
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| Star sequence | Mmu-Mir-26-P1_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0017020 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- CCUAUUCUUGGUUACUUGCACG -61
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-26a-1-3p miRDB: MIMAT0017020 |
