| MirGeneDB ID | Dno-Mir-362-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-362 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dno-mir-362 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Dno-Mir-362-P3a-v1 Dno-Mir-362-P3b Dno-Mir-362-P6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-362-P4 Cfa-Mir-362-P4 Cja-Mir-362-P4 Cpo-Mir-362-P4 Eca-Mir-362-P4 Ete-Mir-362-P4 Hsa-Mir-362-P4 Laf-Mir-362-P4 Mml-Mir-362-P4 Mmr-Mir-362-P4 Mmu-Mir-362-P4 Ocu-Mir-362-P4 Pab-Mir-362-P4 Rno-Mir-362-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (dasNov3) |
JH569306: 1549504-1549562 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-362-P4) |
Mir-188-P1
JH569306: 1544821-1544879 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-188-P2 JH569306: 1545145-1545204 [+] UCSC Ensembl Mir-362-P3a-v1 JH569306: 1548488-1548549 [+] UCSC Ensembl Mir-362-P3a-v2 JH569306: 1548489-1548548 [+] UCSC Ensembl Mir-362-P4 JH569306: 1549504-1549562 [+] UCSC Ensembl Mir-362-P3b JH569306: 1550649-1550711 [+] UCSC Ensembl Mir-188-P3 JH569306: 1554037-1554096 [+] UCSC Ensembl Mir-362-P6 JH569306: 1556109-1556168 [+] UCSC Ensembl |
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| Seed | AUCCUUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCUGAGCCUUCAUGUCUGCUCCCCCUCUCAAAUCCUUGGAACCUAGGUGUGAGUGCUGUUUCAAUGCAACACACCUAUUCAAGGAUUCAAGAGGCUGAGCCUUGUCUGCAUGUAGAAGGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CCUGAGCCUUCAUGUCU--| CC CA ACC A- GCUGU GCUC CCUCU AAUCCUUGGA UAGGUGUG GU \ CGAG GGAGA UUAGGAACUU AUCCACAC CG U GGAAGAUGUACGUCUGUUC^ UC AC --- AA UAACU 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dno-Mir-362-P4_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0047831 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AAUCCUUGGAACCUAGGUGUGAGU -24
Get sequence
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| Star sequence | Dno-Mir-362-P4_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0047832 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- AACACACCUAUUCAAGGAUUCA -59
Get sequence
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