MirGeneDB ID | Mmu-Mir-362-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-362 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mmu-mir-362 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Mmu-Mir-362-P5 Mmu-Mir-362-P6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-362-P4 Cfa-Mir-362-P4 Cja-Mir-362-P4 Cpo-Mir-362-P4 Dno-Mir-362-P4 Eca-Mir-362-P4 Ete-Mir-362-P4 Hsa-Mir-362-P4 Laf-Mir-362-P4 Mml-Mir-362-P4 Mmr-Mir-362-P4 Ocu-Mir-362-P4 Pab-Mir-362-P4 Rno-Mir-362-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (mm10) |
chrX: 7241984-7242042 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-362-P4) |
Mir-362-P6
chrX: 7237694-7237754 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-362-P5 chrX: 7241269-7241328 [-] UCSC Ensembl Mir-362-P4 chrX: 7241984-7242042 [-] UCSC Ensembl Mir-188-P2 chrX: 7247992-7248051 [-] UCSC Ensembl Mir-188-P1 chrX: 7248419-7248477 [-] UCSC Ensembl |
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Seed | AUCCUUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCUGAGCCUUCUUGCUUGCUCCCCCUCUCGAAUCCUUGGAACCUAGGUGUGAAUGCUGCUUCAGUGCAACACACCUGUUCAAGGAUUCAAAGAGGCUGAGCCUUGUCUGCGUGUAGAAUGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 CCUGAGCCUUCUUGCUU- CC C-| ACC AA UGCU GCUC CCUCU GAAUCCUUGGA UAGGUGUG UGC \ CGAG GGAGA CUUAGGAACUU GUCCACAC ACG U UAAGAUGUGCGUCUGUUC UC AA^ --- A- UGAC 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Mmu-Mir-362-P4_5p |
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mirBase accession | MIMAT0000706 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AAUCCUUGGAACCUAGGUGUGAAUGC -26
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000706 TargetScanVert: mmu-miR-362-5p miRDB: MIMAT0000706 |
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Co-mature sequence | Mmu-Mir-362-P4_3p |
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mirBase accession | MIMAT0004684 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- AACACACCUGUUCAAGGAUUCA -59
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004684 TargetScanVert: mmu-miR-362-3p miRDB: MIMAT0004684 |