| MirGeneDB ID | Pbv-Mir-599 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-599 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UUGAUAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Burmese python (Python bivittatus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | pbv-mir-599 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Ami-Mir-599 Bta-Mir-599 Cfa-Mir-599 Cli-Mir-599 Cpi-Mir-599 Ete-Mir-599 Hsa-Mir-599 Lch-Mir-599 Mdo-Mir-599 Mml-Mir-599 Mmu-Mir-599 Mun-Mir-599 Oan-Mir-599 Ocu-Mir-599 Sha-Mir-599 Spt-Mir-599 Tgu-Mir-599 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Sarcopterygii | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Sarcopterygii | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000186305.2_Python_molurus_bivittatus) |
KE953831.1: 12525-12583 [-] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-599) |
Mir-599
KE953831.1: 12525-12583 [-]
Mir-875 KE953831.1: 12662-12720 [-] |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UAGGAUGAAAAACAGAACAUCCACAGUGUGUUUGAUAAGCUGACAUGGGACAGGAAUUCUUUUUCACUGUUGUGUCAAUUUAUCAAACCCAUACGUGGAUAGCAAUCAAAUCCUCUCCUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UAGGAUGAAAAACAGAAC- A-| U C GG GAAUUC AUCCAC GUG GUUUGAUAAG UGACAU GACAG \ UAGGUG UAC CAAACUAUUU ACUGUG UUGUC U UCCUCUCCUAAACUAACGA CA^ C A -- ACUUUU 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Pbv-Mir-599_5p (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUUGAUAAGCUGACAUGGGACAG -23
Get sequence
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| Star sequence | Pbv-Mir-599_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0039070 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- GUUGUGUCAAUUUAUCAAACC -59
Get sequence
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