MirGeneDB ID | Ofu-Mir-1992 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-1992 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Tubeworm (Owenia fusiformis) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Agr-Mir-1992 Cte-Mir-1992 Dgr-Mir-1992 Eba-Mir-1992 Efe-Mir-1992-P3 Efe-Mir-1992-P4 Egr-Mir-1992 Esc-Mir-1992 Gsa-Mir-1992 Hru-Mir-1992 Lan-Mir-1992 Lgi-Mir-1992-P1 Lgi-Mir-1992-P2 Llo-Mir-1992 Mgi-Mir-1992 Mom-Mir-1992 Npo-Mir-1992 Obi-Mir-1992 Ovu-Mir-1992 Pau-Mir-1992 Pcr-Mir-1992 Pdu-Mir-1992 Pve-Mir-1992 Rph-Mir-1992 Sma-Mir-1992 Sme-Mir-1992-P5 Sme-Mir-1992-P6-v1 Snu-Mir-1992 War-Mir-1992 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Platytrochozoa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Platytrochozoa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_903813345.2_Owenia) |
CAIIXF020000007.1: 19293990-19294047 [-] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CAGCAGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UCUUCUGGAUUACACUGUAUUCUGACUGUUCAUUGGUGGAUAAUUGCUGGUAGUAUUUUAUCAUAUCAGCAGUUGUACCACUGAUGGGUAGUUGGGAAACUAACAACAAAAUCACAACGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 UCUUCUGGAUUACACUGUA-- UG UU UG -| GUAUU UUC ACUG CAU GUGG AUAAUUGCUGGUA \ AGG UGAU GUA CACC UGUUGACGACUAU U CAACACUAAAACAACAAUCAA GU GG GU A^ ACUAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Ofu-Mir-1992_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CAUUGGUGGAUAAUUGCUGGUA -22
Get sequence
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Mature sequence | Ofu-Mir-1992_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- UCAGCAGUUGUACCACUGAUGGG -58
Get sequence
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