MirGeneDB ID | Mom-Mir-1992 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-1992 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mossy chiton (Mopalia muscosa) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Agr-Mir-1992 Cte-Mir-1992 Dgr-Mir-1992 Eba-Mir-1992 Efe-Mir-1992-P3 Efe-Mir-1992-P4 Egr-Mir-1992 Esc-Mir-1992 Gsa-Mir-1992 Hru-Mir-1992 Lan-Mir-1992 Lgi-Mir-1992-P1 Lgi-Mir-1992-P2 Llo-Mir-1992 Mgi-Mir-1992 Npo-Mir-1992 Obi-Mir-1992 Ofu-Mir-1992 Ovu-Mir-1992 Pau-Mir-1992 Pcr-Mir-1992 Pdu-Mir-1992 Pve-Mir-1992 Rph-Mir-1992 Sma-Mir-1992 Sme-Mir-1992-P5 Sme-Mir-1992-P6-v1 Snu-Mir-1992 War-Mir-1992 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Platytrochozoa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Platytrochozoa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_031763545.1_ASM3176354v1_genomic_Mom) |
JARFOD010069075.1: 4156-4218 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CAGCAGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GGUGAAGGGAUUAUUUUGUGGCUACCAAUACGUCAGUGCUACAUUGCUGGUAGUAACAUUUCUUCACCUAUCAGCAGUUGUACCACUGAUUUGUUGUUUGCUUACAGUAAACUACUGAUGUCCGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 GGUGAAGGGAUUAUUUU- - UAC C C -| GUAACAU GU GGC CAAUA GUCAGUG UAC AUUGCUGGUA U CA UCG GUUGU UAGUCAC AUG UGACGACUAU U CCUGUAGUCAUCAAAUGA U UUU U C U^ CCACUUC 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mom-Mir-1992_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CGUCAGUGCUACAUUGCUGGUA -22
Get sequence
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Mature sequence | Mom-Mir-1992_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
40- UCAGCAGUUGUACCACUGAUUUG -63
Get sequence
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