| MirGeneDB ID | Ocu-Mir-128-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-128 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Rabbit (Oryctolagus cuniculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | ocu-mir-128a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Ocu-Mir-128-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aca-Mir-128-P2 Ami-Mir-128-P2 Bta-Mir-128-P2 Cfa-Mir-128-P2 Cja-Mir-128-P2 Cli-Mir-128-P2 Cmi-Mir-128-P2 Cpi-Mir-128-P2 Cpo-Mir-128-P2 Dno-Mir-128-P2 Dre-Mir-128-P2a Dre-Mir-128-P2b Ebu-Mir-128 Eca-Mir-128-P2 Ete-Mir-128-P2 Gga-Mir-128-P2 Gja-Mir-128-P2 Gmo-Mir-128-P2a Gmo-Mir-128-P2b Hsa-Mir-128-P2 Laf-Mir-128-P2 Lch-Mir-128-P2 Loc-Mir-128-P2 Mal-Mir-128-P2a Mdo-Mir-128-P2 Mml-Mir-128-P2 Mmr-Mir-128-P2 Mmu-Mir-128-P2 Mun-Mir-128-P2 Neu-Mir-128-P2 Oan-Mir-128-P2 Pab-Mir-128-P2 Pbv-Mir-128-P2 Pma-Mir-128-o2 Rno-Mir-128-P2 Sha-Mir-128-P2 Spt-Mir-128-P2 Sto-Mir-128-P2 Tgu-Mir-128-P2 Tni-Mir-128-P2a Xla-Mir-128-P2c Xla-Mir-128-P2d Xtr-Mir-128-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (oryCun2_add) |
chr7: 72954506-72954561 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CACAGUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UAAUUGGCCUUGUUUCUGAGCUGUUGGAUUCGGGGCCGUAGCACUGUCUGAGAGGUUUACAUUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUUCAGCUGCUUCCUGACUUCUUUUUACUCAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UAAUUGGCCUUGUUUCU--| U UUC UAG CU GGUU GAGC GUUGGA GGGGCCG CACUGU GAGA U UUCG CGACUU CUCUGGC GUGACA CUCU A ACUCAUUUUUCUUCAGUCC^ U UUU CAA -- UUAC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Ocu-Mir-128-P2_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0048210 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CGGGGCCGUAGCACUGUCUGAGA -23
Get sequence
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| Mature sequence | Ocu-Mir-128-P2_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0048211 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- UCACAGUGAACCGGUCUCUUU -56
Get sequence
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