| MirGeneDB ID | Neu-Mir-1805 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1805 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Tammar Wallaby (Notamacropus eugenii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aca-Mir-1805 Ami-Mir-1805 Cli-Mir-1805 Cpi-Mir-1805 Gga-Mir-1805 Gja-Mir-1805-P3 Gja-Mir-1805-P4 Mdo-Mir-1805 Pbv-Mir-1805 Sha-Mir-1805 Spt-Mir-1805 Tgu-Mir-1805 Xla-Mir-1805-P1 Xla-Mir-1805-P2 Xtr-Mir-1805 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Tetrapoda | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Tetrapoda | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_028372415.1_mMacEug1.pri) |
CM051817.1: 401946502-401946562 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GUAUUGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGGGAAAGAAUGGAAGGGAUGGAUUCUGGGAGUUGUAGCCUUUCAAACAGAGCUCUGAAUGUACACACCUGUAUUGGAACACUACAGCUCCCCGAACUUCCUCAUGUCACUCCCUGUCUAAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UGGGAAAGAAUGGAAGG- U -- U CC -| AGCUCUGA GA GGA UUC GGGAGUUGUAG UUUCAA ACAG A CU CCU AAG CCCUCGACAUC AAGGUU UGUC U AAUCUGUCCCUCACUGUA - UC C AC A^ CACACAUG . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Neu-Mir-1805_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGUUGUAGCCUUUCAAACAGA -21
Get sequence
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| Mature sequence | Neu-Mir-1805_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- UGUAUUGGAACACUACAGCUCC -61
Get sequence
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