MirGeneDB ID | Mun-Mir-383 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-383 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GAUCAGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Microcaecilia (Microcaecilia unicolor) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aca-Mir-383-v1 Aca-Mir-383-v2 Ami-Mir-383-v1 Ami-Mir-383-v2 Bta-Mir-383-v1 Bta-Mir-383-v2 Cfa-Mir-383-v1 Cfa-Mir-383-v2 Cli-Mir-383-v1 Cli-Mir-383-v2 Cpi-Mir-383-v1 Cpi-Mir-383-v2 Cpo-Mir-383-v1 Cpo-Mir-383-v2 Dno-Mir-383-v1 Dno-Mir-383-v2 Ete-Mir-383-v1 Ete-Mir-383-v2 Gga-Mir-383-v1 Gga-Mir-383-v2 Gja-Mir-383-v1 Gja-Mir-383-v2 Hsa-Mir-383-v1 Hsa-Mir-383-v2 Mdo-Mir-383-v1 Mdo-Mir-383-v2 Mml-Mir-383-v1 Mml-Mir-383-v2 Mmu-Mir-383-v1 Mmu-Mir-383-v2 Oan-Mir-383-v1 Oan-Mir-383-v2 Ocu-Mir-383-v1 Ocu-Mir-383-v2 Pbv-Mir-383-v1 Pbv-Mir-383-v2 Rno-Mir-383-v1 Rno-Mir-383-v2 Sha-Mir-383-v1 Sha-Mir-383-v2 Spt-Mir-383 Tgu-Mir-383-v1 Tgu-Mir-383-v2 Xla-Mir-383-P1 Xla-Mir-383-P2 Xtr-Mir-383-v1 Xtr-Mir-383-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Tetrapoda | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Tetrapoda | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Mun_miRNA_loci) |
383_LR594633.1:562031711-562031851: 41-101 [-] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | ACAGCUGCAUUUCAAAGUCACCUGCUCUUCAGAUCAGAAGGUGAUUGUGGCUUUGAAUAGAUUAAAACAGCCACAGCACUGCCUGGUCAGAAAGAGCAAGUGUACUAGCCUUUCUUCUCAUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 ACAGCUGCAUUUCAAAGU- C -| A AA A UUGAAUA CAC UGCUC UUC GAUCAG GGUG UUGUGGCU G GUG ACGAG AAG CUGGUC UCAC GACACCGA A UACUCUUCUUUCCGAUCAU A A^ A CG - CAAAAUU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Mun-Mir-383_5p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGAUCAGAAGGUGAUUGUGGCU -22
Get sequence
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Star sequence | Mun-Mir-383_3p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
40- CCACAGCACUGCCUGGUCAGA -61
Get sequence
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