| MirGeneDB ID | Loc-Mir-137-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-137 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Spotted gar (Lepisosteus oculatus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Loc-Mir-137-P1-v1 Loc-Mir-137-P3-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aca-Mir-137-P3-v1 Aga-Mir-137 Agr-Mir-137 Ami-Mir-137-P3-v1 Asu-Mir-137 Ava-Mir-137 Bfl-Mir-137 Bko-Mir-137 Bpl-Mir-137 Cbr-Mir-137 Cel-Mir-137 Cli-Mir-137-P3 Cpi-Mir-137-P3-v1 Cte-Mir-137 Dan-Mir-137 Dgr-Mir-137 Dma-Mir-137 Dme-Mir-137 Dmo-Mir-137 Dpu-Mir-137 Dsi-Mir-137 Dya-Mir-137 Eba-Mir-137 Ebu-Mir-137 Esc-Mir-137 Gga-Mir-137-P3-v1 Gja-Mir-137-P3 Gmo-Mir-137-P3a-v1 Gmo-Mir-137-P3b-v1 Gpa-Mir-137 Hme-Mir-137 Hru-Mir-137 Isc-Mir-137 Lan-Mir-137 Lch-Mir-137-P3 Lgi-Mir-137 Lhy-Mir-137 Llo-Mir-137 Mal-Mir-137-P3a-v1 Mal-Mir-137-P3b-v1 Mdo-Mir-137-P3-v1 Mgi-Mir-137 Mom-Mir-137 Mun-Mir-137-P3 Neu-Mir-137-P3 Oan-Mir-137-P3-v1 Obi-Mir-137 Ofu-Mir-137 Pau-Mir-137 Pbv-Mir-137-P3-v1 Pca-Mir-137 Pdu-Mir-137 Pma-Mir-137-o3 Pve-Mir-137 Rph-Mir-137 Sha-Mir-137-P3 Sko-Mir-137 Snu-Mir-137 Spu-Mir-137 Tni-Mir-137-P3b Tur-Mir-137 War-Mir-137 Xbo-Mir-137 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (LepOcu1) |
LG6: 16741016-16741074 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-137-P3-v2) |
Mir-137-P3-v1
LG6: 16741016-16741074 [-]
Ensembl
Mir-137-P3-v2 LG6: 16741016-16741074 [-] Ensembl |
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| Variant | Loc-Mir-137-P3-v2 |
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| Seed | AUUGCUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GGAGGCUACGCCACCUGCUCCGUCUCAGCCACGGGUAUUCUUGGGUAGAUAAUACGGAUGUCGUUGUUAUUGCUUGAGAAUACGCGUAGCUGGGUGGAGUCCCUGCGACAAGCCCCACCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GGAGGCUACGCCACCUG---| U C G UG A UACGGA CUCCG CUCAGC ACG GUAUUCU GGUAG UAA U GAGGU GGGUCG UGC CAUAAGA UCGUU AUU G CCACCCCGAACAGCGUCCCU^ - A G GU - GUUGCU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Loc-Mir-137-P3-v2_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACGGGUAUUCUUGGGUAGAUAA -22
Get sequence
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| Mature sequence | Loc-Mir-137-P3-v2_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- UAUUGCUUGAGAAUACGCGUAG -59
Get sequence
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| Variant | Loc-Mir-137-P3-v1 |
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| Seed | UAUUGCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GGAGGCUACGCCACCUGCUCCGUCUCAGCCACGGGUAUUCUUGGGUAGAUAAUACGGAUGUCGUUGUUAUUGCUUGAGAAUACGCGUAGCUGGGUGGAGUCCCUGCGACAAGCCCCACCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GGAGGCUACGCCACCUG---| U C G UG A ACGGA CUCCG CUCAGC ACG GUAUUCU GGUAG UAAU U GAGGU GGGUCG UGC CAUAAGA UCGUU AUUG G CCACCCCGAACAGCGUCCCU^ - A G GU - UUGCU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Loc-Mir-137-P3-v1_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACGGGUAUUCUUGGGUAGAUAAU -23
Get sequence
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| Mature sequence | Loc-Mir-137-P3-v1_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- UUAUUGCUUGAGAAUACGCGUAG -59
Get sequence
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