| MirGeneDB ID | Gmo-Mir-208-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-208 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UAAGACG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Cod (Gadus morhua) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | gmo-mir-736 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-208-P1 Cfa-Mir-208-P1 Cpo-Mir-208-P1 Dno-Mir-208-P1 Dre-Mir-208-P1 Ebu-Mir-208-o1 Ete-Mir-208-P1a Ete-Mir-208-P1b Hsa-Mir-208-P1 Lch-Mir-208-P1 Loc-Mir-208-P1c Loc-Mir-208-P1d Loc-Mir-208-P1e Mal-Mir-208-P1 Mdo-Mir-208-P1 Mml-Mir-208-P1 Mmu-Mir-208-P1 Mun-Mir-208-P1 Ocu-Mir-208-P1 Rno-Mir-208-P1 Sha-Mir-208-P1 Sto-Mir-208-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Gadus_morhua.gadMor1.dna.toplevel) |
GeneScaffold_3162: 31714-31769 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AAAGAAAAAACGUAAUUCCAUCCUGCAGAUCAGCUUUUUGUUUGUGCUAUGUUGCUUUUAAAAUGUAAGACGAACAAAAAGUUUGUCUGUUAGAUGACCGAGCAACCUUUGUACUAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 AAAGAAAAAACGUAAUUC--| CU C GC UGCU CAUC GCAGAU AGCUUUUUGUUUGU UAUGU U GUAG UGUCUG UUGAAAAACAAGCA AUGUA U AUCAUGUUUCCAACGAGCCA^ AU U GA AAAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Gmo-Mir-208-P1_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0044211 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CAGCUUUUUGUUUGUGCUAUGU -22
Get sequence
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| Mature sequence | Gmo-Mir-208-P1_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0044212 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
34- GUAAGACGAACAAAAAGUUUGU -56
Get sequence
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