MirGeneDB ID | Gga-Mir-137-P3-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-137 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AUUGCUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Chicken (Gallus gallus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Gga-Mir-137-P1-v1 Gga-Mir-137-P1-v2 Gga-Mir-137-P3-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aca-Mir-137-P3-v1 Aca-Mir-137-P3-v2 Ami-Mir-137-P3-v1 Ami-Mir-137-P3-v2 Asu-Mir-137 Bfl-Mir-137 Cbr-Mir-137 Cel-Mir-137 Cgi-Mir-137 Cli-Mir-137-P3 Cpi-Mir-137-P3-v1 Cpi-Mir-137-P3-v2 Cte-Mir-137 Dan-Mir-137 Dma-Mir-137 Dme-Mir-137 Dmo-Mir-137 Dpu-Mir-137 Dsi-Mir-137 Dya-Mir-137 Ebu-Mir-137 Esc-Mir-137 Gja-Mir-137-P3 Gmo-Mir-137-P3a-v1 Gmo-Mir-137-P3a-v2 Gmo-Mir-137-P3b-v1 Gmo-Mir-137-P3b-v2 Hme-Mir-137 Isc-Mir-137 Lan-Mir-137 Lch-Mir-137-P3 Lgi-Mir-137 Loc-Mir-137-P3-v1 Loc-Mir-137-P3-v2 Mal-Mir-137-P3a-v1 Mal-Mir-137-P3a-v2 Mal-Mir-137-P3b-v1 Mal-Mir-137-P3b-v2 Mdo-Mir-137-P3-v1 Mdo-Mir-137-P3-v2 Mun-Mir-137-P3 Oan-Mir-137-P3-v1 Oan-Mir-137-P3-v2 Obi-Mir-137 Pbv-Mir-137-P3-v1 Pbv-Mir-137-P3-v2 Pma-Mir-137-o3 Sha-Mir-137-P3 Sko-Mir-137 Spu-Mir-137 Tni-Mir-137-P3b Xbo-Mir-137 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Gallus_gallus.GRCg6a) |
18: 11367831-11367890 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | ACCCCGGAUGCCCCCCCCGCGCCCCGCGGUGACGGGUAUUCUCGGGCGGAUAACACGGCCGCGCUGUUAUUGCUGGAGAAUACGCGUAGCCGAGGGGACGCCCCGAGCCGGCCUCCUCGUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 ACCCCGGAUGCCCCCCCC- -| G G G G G ACGGC GCG CCCC CGGU ACG GUAUUCUC GGCG AUAAC \ CGC GGGG GCCG UGC CAUAAGAG UCGU UAUUG C UGCUCCUCCGGCCGAGCCC A^ A A G G - UCGCG . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Gga-Mir-137-P3-v2_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- GACGGGUAUUCUCGGGCGGAUAAC -24
Get sequence
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Mature sequence | Gga-Mir-137-P3-v2_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- UAUUGCUGGAGAAUACGCGUAGC -60
Get sequence
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