| MirGeneDB ID | Dsi-Mir-3-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-3 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila simulans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dsi-mir-318 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Dsi-Mir-3-P1 Dsi-Mir-3-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Dan-Mir-3-P3 Dlo-Mir-3 Dma-Mir-3 Dme-Mir-3-P3 Dmo-Mir-3-P3 Dpu-Mir-3 Dya-Mir-3-P3 Gpa-Mir-3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Pancrustacea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_simulans.ASM75419v3.dna.toplevel) |
3R: 14842658-14842715 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-3-P3) |
Mir-3-P3
3R: 14842658-14842715 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-2-P9-v1 3R: 14842807-14842875 [-] UCSC Ensembl Mir-2-P9-v2 3R: 14842808-14842874 [-] UCSC Ensembl |
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| Seed | CACUGGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UAUGAAAAGGUCCUUCGGUUUCAGUUUAUGGGAUACACACAGUUCAGUUUUGUCACACUUUAAGCAUCACUGGGCUUUGUUUAUCUCAUGAGAGCGAAAUUUAUUCAACAGGGAACCUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UAUGAAAAGGUCCUUCG- AG-| C C UU UCACA GUUUC UUUAUGGGAUA ACA AGUUCAGU UG C UAAAG GAGUACUCUAU UGU UCGGGUCA AC U UCCAAGGGACAACUUAUU CGA^ U U CU GAAUU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dsi-Mir-3-P3_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GGAUACACACAGUUCAGUUUUG -22
Get sequence
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| Mature sequence | Dsi-Mir-3-P3_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0008907 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- UCACUGGGCUUUGUUUAUCUCA -58
Get sequence
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