| MirGeneDB ID | Dme-Mir-281-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-281 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila melanogaster) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dme-mir-281-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Dme-Mir-281-P2-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-281 Aga-Mir-281 Agr-Mir-281 Asu-Mir-281 Bfl-Mir-281 Bge-Mir-281 Bko-Mir-281 Bla-Mir-281 Bpl-Mir-281 Cin-Mir-281 Csc-Mir-281 Cte-Mir-281 Dan-Mir-281-P1-v1 Dgr-Mir-281 Dlo-Mir-281 Dma-Mir-281 Dmo-Mir-281-P1-v1 Dpu-Mir-281 Dsi-Mir-281-P1-v1 Dya-Mir-281-P1-v1 Eba-Mir-281 Ebu-Mir-281 Egr-Mir-281 Esc-Mir-281 Gpa-Mir-281-P1-v1 Gsa-Mir-281 Hme-Mir-281 Hru-Mir-281 Isc-Mir-281 Lhy-Mir-281 Llo-Mir-281 Mgi-Mir-281 Mom-Mir-281 Npo-Mir-281 Obi-Mir-281 Ofu-Mir-281 Ovu-Mir-281 Pca-Mir-281 Pcr-Mir-281 Pdu-Mir-281 Pfl-Mir-281 Rph-Mir-281 Sko-Mir-281 Sma-Mir-281 Sme-Mir-281 Snu-Mir-281 Sto-Mir-281 Tca-Mir-281 Tur-Mir-281 War-Mir-281 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Nephrozoa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_melanogaster_BDGP6) |
2R: 12170383-12170449 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-281-P1-v1) |
Mir-988
2R: 12158888-12158945 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-281-P2-v1 2R: 12170164-12170230 [-] UCSC Ensembl Mir-281-P2-v2 2R: 12170164-12170230 [-] UCSC Ensembl Mir-281-P1-v1 2R: 12170383-12170449 [-] UCSC Ensembl Mir-281-P1-v2 2R: 12170384-12170448 [-] UCSC Ensembl |
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| Variant | Dme-Mir-281-P1-v1 |
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| Seed | GUCAUGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAAAUCGAAUCCAAAUGCGAAUAAGUGAAUAAAGAGAGCUGUCCGUCGACAGUCCAGAAACUAUUUAAUAUCACUGUCAUGGAAUUGCUCUCUUUGUAUAAUAUUCGACGAUGCGCUGUGAGGCAAUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 CAAAUCGAAUCCAAAUG---| AG A UG- C CCAGAAACU CGAAUA UG AUAAAGAGAGC UCCGU GACAGU \ GCUUAU AU UGUUUCUCUCG AGGUA CUGUCA A UAACGGAGUGUCGCGUAGCA^ A- A UUA - CUAUAAUUU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dme-Mir-281-P1-v1_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0000344 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AAAGAGAGCUGUCCGUCGACAGU -23
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000344 |
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| Mature sequence | Dme-Mir-281-P1-v1_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0000345 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
44- UGUCAUGGAAUUGCUCUCUUUGU -67
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000345 |
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| Variant | Dme-Mir-281-P1-v2 |
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| Seed | UGUCAUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AAAUCGAAUCCAAAUGCGAAUAAGUGAAUAAAGAGAGCUGUCCGUCGACAGUCCAGAAACUAUUUAAUAUCACUGUCAUGGAAUUGCUCUCUUUGUAUAAUAUUCGACGAUGCGCUGUGAGGCAAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 AAAUCGAAUCCAAAUGC---| AG A UG- C CCAGAAACU GAAUA UG AUAAAGAGAGC UCCGU GACAGU \ CUUAU AU UGUUUCUCUCG AGGUA CUGUCA A AACGGAGUGUCGCGUAGCAG^ A- A UUA - CUAUAAUUU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
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| Star sequence | Dme-Mir-281-P1-v2_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0000344 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AAGAGAGCUGUCCGUCGACAGUC -23
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000344 |
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| Mature sequence | Dme-Mir-281-P1-v2_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0000345 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
42- CUGUCAUGGAAUUGCUCUCUUUG -65
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000345 |
